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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001586`

染色体: Chr04 坐标: 26363246-26364595 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001586`
名称	SmilChr04G001586
描述	probable inactive DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM3
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26363246 - 26364595 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023215`
GeneID	`131023215`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023215`
原始查询	`SmilChr04G001586`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM3
产物	probable inactive DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM3
Arabidopsis	`AT3G05940` (AT3G05940) organic solute transporter ostalpha protein (DUF300) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819764] identity=60.9; qcov=0.413; evalue=7.65e-16; confidence=low
Rice	`Os07g0244300` (OJ1341_A08.136) - identity=62.5; qcov=0.413; evalue=5.89e-16; confidence=low
GO	GO:0005215 (transporter activity); GO:0006810 (transport)
KEGG	-
Pfam	PF03619 (Solute_trans_a)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023215

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808740.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808740.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808740.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808740.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808740.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26363249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,B78
`Chr4:26363259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B79,B84
`Chr4:26363302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr4:26363593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr4:26363623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr4:26363625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B139,D5
`Chr4:26363845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B36
`Chr4:26363887`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C80
`Chr4:26363887`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C80
`Chr4:26363899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B3,B32,C10
`Chr4:26364176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C34,C9
`Chr4:26364179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808740.1

155 aa

155

Solute_trans_a

PF03619 Solute_trans_a 1-46 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808740.1`	Pfam	`PF03619`	Solute_trans_a	Family	1	46	1.7e-10	41.4	Organic solute transporter Ostalpha

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952757.1
ATGGCACTTTATGCGTTGTTGGCCTTGTTTTATGTAGCTTGCAGAGATTTACTTCAGCCATTCAATCCTGTTCCGAACTTCATCATAATCAAATATGTAGTATTTCTTACATACTGGCAGTGTGATGTAGTGGACATTTCAGATGATGAGGATTCCTTTTTGCTGGAAAATGATGCTGGAGTTATACCCAAGGATGAGAATTTGAATTATGATTTACCACCGCCGAAAACATTCTCAATGCCAAGGGAGGAGGATGGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023215
ATGGCACTTTATGCGTTGTTGGCCTTGTTTTATGTAGCTTGCAGAGATTTACTTCAGCCATTCAATCCTGTTCCGAACTTCATCATAATCAAATATGTAGTATTTCTTACATACTGGCAGTGTGATGTAGTGGACATTTCAGATGATGAGGATTCCTTTTTGCTGGAAAATGATGCTGGAGTTATACCCAAGGATGAGAATTTGAATTATGATTTACCACCGCCGAAAACATTCTCAATGCCAAGGGAGGAGGATGGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808740.1
MALYALLALFYVACRDLLQPFNPVPNFIIIKYVVFLTYWQCDVVDISDDEDSFLLENDAGVIPKDENLNYDLPPPKTFSMPREEDGASSSGTNLRSSFIGMGFAPALVDKAIKEKDEENSELILEALFSYDVSVNPRKIKVINYHIFILLDFGLT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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