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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001589`

染色体: Chr04 坐标: 26434610-26447875 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001589`
名称	SmilChr04G001589
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26434610 - 26447875 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020022`
GeneID	`131020022`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020022`
原始查询	`SmilChr04G001589`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140
Arabidopsis	`AT1G56130` (AT1G56130) Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842065] identity=59.2; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0203400` (SHR5) - identity=57.3; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF11721 (Malectin); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020022

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804634.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804634.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804634.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804634.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804634.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26435037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr4:26435054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr4:26435132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C77
`Chr4:26435157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr4:26437613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B90,B92,C87,D6
`Chr4:26437641`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr4:26437641`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr4:26438641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B112,B124,B38,C22
`Chr4:26438645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B112,B124,B38,C22
`Chr4:26439407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B88
`Chr4:26439445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B83,C59
`Chr4:26439448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804634.1

1042 aa

521

1042

LRR_14

LRR_1

Malectin

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF23598 LRR_14 91-328 aa PF00560 LRR_1 126-147 aa PF00560 LRR_1 294-315 aa PF00560 LRR_1 318-338 aa PF00560 LRR_1 362-382 aa PF11721 Malectin 429-613 aa PF00069 Pkinase 698-897 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 699-962 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804634.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	91	328	1.7e-16	60.7	Leucine-rich repeat region
`XP_057804634.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	126	147	2.6e-19	65.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057804634.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	294	315	2.6e-19	65.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057804634.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	318	338	2.6e-19	65.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057804634.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	362	382	2.6e-19	65.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057804634.1`	Pfam	`PF11721`	Malectin	Domain	429	613	2.7e-36	125.8	Malectin domain
`XP_057804634.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	698	897	4.8e-45	154.7	Protein kinase domain
`XP_057804634.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	699	962	7e-46	157.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948651.1
CGTACAATATTTAAAATACTGCCATCTAATCTTCCCACACACAAACACGCACCCCCTTCTTCTCAAAGAGTTAGTCCTTGCCTCTTCGAATATTTGAAACAATCATTTCTCATATGGCGGCGGCACCACCACCTATCCGGTGGCGGCTGGCGGTTTTCTTGGTTGTGTTCGCCTCTACCCACGTGGTGCAAAATGGGCAAGCTCAAACTACAACCGGAAACGCCACCACTGATCCATCTGAAGCAAGAGCTCTAAACCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020022
ATGGCGGCGGCACCACCACCTATCCGGTGGCGGCTGGCGGTTTTCTTGGTTGTGTTCGCCTCTACCCACGTGGTGCAAAATGGGCAAGCTCAAACTACAACCGGAAACGCCACCACTGATCCATCTGAAGCAAGAGCTCTAAACCGCATGTTTGAGAGATGGGGAATTTCAGCGACGAATAATTGGAACATTAGCGGCGAGCTATGCAGCGGCGTTGCCACTAATGCAACTGATGTTGAAACCAATAATATTAATCCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804634.1
MAAAPPPIRWRLAVFLVVFASTHVVQNGQAQTTTGNATTDPSEARALNRMFERWGISATNNWNISGELCSGVATNATDVETNNINPSIKCDCSYDNNSICHIILLRVYAMNVVGPLPDELWNFTYLTNLNLAQNYLTGPIPAAVGNLTRMQYLSFGINALSGTIPRELGLLTDLRSLSFGTNNFSGPLPSELGSLTRLTQIYINSAGVSGPIPPTFANLRNMETVWASDNGFTGQIPDFIGNWINLAQLRFQGNSFEGPI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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