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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001593`

染色体: Chr04 坐标: 26520857-26544913 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001593`
名称	SmilChr04G001593
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26520857 - 26544913 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020023`
GeneID	`131020023`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020023`
原始查询	`SmilChr04G001593`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140
Arabidopsis	`AT1G56130` (AT1G56130) Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842065] identity=58.1; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0203400` (SHR5) - identity=55.8; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF11721 (Malectin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020023

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804635.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804635.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804635.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804635.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804635.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26521042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B88
`Chr4:26521143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B33,B65,B77,C14
`Chr4:26521152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B53
`Chr4:26521262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:26521297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr4:26521304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B66,C11
`Chr4:26523640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:26523754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,D5
`Chr4:26523815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B90
`Chr4:26524669`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr4:26524669`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B103
`Chr4:26525212`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804635.1

1040 aa

520

1040

LRR_1

Malectin

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00560 LRR_1 127-148 aa PF00560 LRR_1 246-268 aa PF00560 LRR_1 295-316 aa PF00560 LRR_1 319-340 aa PF00560 LRR_1 365-385 aa PF11721 Malectin 433-616 aa PF00069 Pkinase 697-896 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 698-961 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804635.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	127	148	8e-21	70.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057804635.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	246	268	8e-21	70.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057804635.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	295	316	8e-21	70.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057804635.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	319	340	8e-21	70.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057804635.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	365	385	8e-21	70.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057804635.1`	Pfam	`PF11721`	Malectin	Domain	433	616	1.9e-33	116.5	Malectin domain
`XP_057804635.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	697	896	9.2e-45	153.8	Protein kinase domain
`XP_057804635.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	698	961	4.2e-45	154.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948652.1
ATGATTACACGTACAATATTTAAAATACTGCCATCTAATCTTCCCACACACAAACACGCATCCCCTTCTTCTCAAAGAGTTAGTCCTTGCCTCTTCGAATATTTGAAACACTCATTTCTCATATGGCGGCGGCGGCACCACCACCTATCCGGTGGCGGCTGGCGGTTTTCTTGGTTGTGTTCGCCTCTACCCACGTGGTGCAAAATGGGCAAGCTCAAACTACAACCGGAAACGCCACCACTGATCCATCTGAAGCAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020023
ATGGCGGCGGCGGCACCACCACCTATCCGGTGGCGGCTGGCGGTTTTCTTGGTTGTGTTCGCCTCTACCCACGTGGTGCAAAATGGGCAAGCTCAAACTACAACCGGAAACGCCACCACTGATCCATCTGAAGCAAGAGCTCTAAACCGCATGTTTGAGAGATGGGGAATTTCAGCGACAAATAATTGGAACATTAGCGGCGAGCTATGCAGCGGCGTTGCCACTAATGCAACTGATGTTGAAACCAATAATATTAATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804635.1
MAAAAPPPIRWRLAVFLVVFASTHVVQNGQAQTTTGNATTDPSEARALNRMFERWGISATNNWNISGELCSGVATNATDVETNNINPSIKCDCSYDNNSTCHIILLRVYALSVAGPLPDELWNFTYLTNLNLAQNYFTGPIPAAIGNLTRMQYLTFGINALSGTIPRELGLLTGLRSLSFGTNNFSGPLPSELGSLTRLTQIYINSAGVSGPIPPTFANLRKMERVWASDNGLTGQIPDFIGNWINLVVLRFQGNSFEGP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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