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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001600`

染色体: Chr04 坐标: 26676919-26680735 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001600`
名称	SmilChr04G001600
描述	uncharacterized SmilChr04G001600
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26676919 - 26680735 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020031`
GeneID	`131020031`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020031`
原始查询	`SmilChr04G001600`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Outer membrane OMP85 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830435]; symbol=AT5G05520; hit=AT5G05520; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Outer membrane OMP85 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830435]; symbol=AT5G05520; hit=AT5G05520; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G05520` (AT5G05520) Outer membrane OMP85 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830435] identity=52; qcov=0.912; evalue=1.73e-176; confidence=high
Rice	`Os05g0470800` - identity=55.4; qcov=0.904; evalue=5.15e-168; confidence=high
GO	GO:0001401 (SAM complex); GO:0019867 (outer membrane); GO:0045040 (protein insertion into mitochondrial outer membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01103 (Omp85); PF07244 (POTRA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020031

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057804643.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057804643.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057804643.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057804643.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057804643.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26677220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B64
`Chr4:26677220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr4:26677225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C58
`Chr4:26677284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B90,B92,C87,D6
`Chr4:26678044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B90,B92,C87,D6
`Chr4:26678090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:26678110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C13
`Chr4:26678234`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	B100,B101,B103,B109,B11,B114,B139,B19,B25,B45,B49,B5,B57,B73,B85,B91,C1,C15,C17,C25,C41,C49,C56,C57,C65,C73,C76,C79,C8,C83,C84
`Chr4:26678443`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	B100,B101,B103,B108,B109,B11,B114,B139,B19,B25,B45,B49,B5,B57,B73,B91,C1,C23,C25,C41,C49,C56,C57,C65,C73,C76,C79,C8,C83,C84
`Chr4:26678963`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	B100,B101,B103,B108,B11,B114,B139,B19,B25,B45,B85,B91,C1,C15,C17,C23,C25,C41,C49,C56,C73,C76,C79,C8,C83,C84
`Chr4:26679122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B5,B57,B73,C25,C79
`Chr4:26679188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804643.1

521 aa

260

521

POTRA

Omp85

PF07244 POTRA 63-141 aa PF01103 Omp85 171-517 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804643.1`	Pfam	`PF07244`	POTRA	Domain	63	141	0.00026	22.4	Surface antigen variable number repeat
`XP_057804643.1`	Pfam	`PF01103`	Omp85	Domain	171	517	2.3e-24	87.2	Omp85 superfamily domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948660.1
AAAAGCAAAATGAACTAGAATCTGAAAAAGCCGAAAAGGATTACTTGCTACTCACATTCACATTTTCTTTTTTTTTAACGCACGCTGAGAGTCACAGTTATAATGTCGGAACTCGATAACAGTAATTCCTCAGTCCTCACCTAACGCCTAACGAGTAACGACATCGTTGACGGTTTCGATCAGCAACTAGTCGTGCTCTCTCCCCACTATTCAGTAACTGCCGCCGCCTGATGGAAGCTCAGCCGGAACCACCGGCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020031
ATGGAAGCTCAGCCGGAACCACCGGCTTCCGACCCCGAAGATCTCGAAGAATTTGAGGATGTGTTCGATGACTTCGACTTCGAAGATGATGAGCGAGAAGACTTTGAATCCACGATTCCGATGCCCAGAGACGCCGCTACGATAGAGGCTCTAATTCGGCAGCTGTCGGCGGAGGAGAGGGTGGTGGTGCGGGTGAATGACGTTATCATCAAGGGCAACACCAGGACCTATTACTCCTTGATTGCGGCCGAGGTGGAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804643.1
MEAQPEPPASDPEDLEEFEDVFDDFDFEDDEREDFESTIPMPRDAATIEALIRQLSAEERVVVRVNDVIIKGNTRTYYSLIAAEVEPLFTEATSFRQLLRAAAAANARLKQLGLFDSVTITLGAGPPGFPVTVDVVIEVSEAKNRLTGDLGIYFEPEARSHSVEGSLKLKNLYGLGDLWVGSVAYGLGQMSEISMGLSLPTFTGLATPLSARMSLLSLDGLKFSSHRKQVLGLSLGLFSIGNHDVSYNLSWRSLADPSED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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