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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001620`

染色体: Chr04 坐标: 26960806-26965145 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001620`
名称	SmilChr04G001620
描述	uncharacterized SmilChr04G001620
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26960806 - 26965145 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020047`
GeneID	`131020047`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020047`
原始查询	`SmilChr04G001620`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G31150` (AT1G31150) K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000] identity=26.2; qcov=0.266; evalue=1.51e-13; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016926 (protein desumoylation); GO:0016929 (deSUMOylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF09331 (DUF1985)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020047

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804664.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057804664.1`
3	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057804664.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057804664.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804664.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26961690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr4:26961695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C28,C80,D7
`Chr4:26961725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:26961871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr4:26961890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B95,C1,C76
`Chr4:26961944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:26961951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr4:26961974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,B95
`Chr4:26961988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C42
`Chr4:26962025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B67,B99
`Chr4:26962052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,D6
`Chr4:26962054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804664.1

975 aa

488

975

DUF1985

Peptidase_C48

PF09331 DUF1985 115-240 aa PF02902 Peptidase_C48 789-967 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804664.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	115	240	1.3e-13	51.9	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057804664.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	789	967	1.2e-14	55.4	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948681.1
TTGTATCACACTCCATAAATAAATAAGTTTTGTAGCACATTCTTAATGGTCCCACCAAATCTTTGATTTATTTAAAAAATTTGTTTTCTTTAAACAATAAAAAACGTGGCTGATAGAATCTTCTATCATTATCACGATTTGTCTTATTATGTCTCTCTCTCTCTCTTCCAAAATCGTGATCTGATAGTATATCTTTTAGGGTTTAGGGTTTCTTTTCTTGCATGTACACGATTTGGAAGCATGAATCGTGAGGATCGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020047
ATGAGTTCAACGGAATCAGATTACGATGGGGAAGAACAGCCTGTAGAACGAGGCCATCGCCCGAGTACATCGAGGAGGGAAAAATACCCGACGCCGAATCCGCCTCCGAGGCATGTTTGGTTACGTCCGTGCATGCAAGGTTATGCCGGACGAATCAATCACTATGTGAAGGACACGACACTGAAGGAAGTGGAGACCTGTCTGACGCACTACCAGCGATTGGAACAATTTAATCAAGGTCCGTTTGGGCATTTACTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804664.1
MSSTESDYDGEEQPVERGHRPSTSRREKYPTPNPPPRHVWLRPCMQGYAGRINHYVKDTTLKEVETCLTHYQRLEQFNQGPFGHLLQLKRQDSANAALHHLLARELYDEAFGPWEKWFHVGGHDIRFGAVEYCLVTGLCFGPSPQRFDPDVDHRVGKQSLWHRVLKGKKVEVKDLRKRFVSRSLGNSAQDYLKAANILVAYDLIFCRDYKYVHEWVWALVEEDQAWSDFPWGSYSFQILCHGMSVLKKHPNEITGNRKTY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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