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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001622`

染色体: Chr04 坐标: 26990749-26993464 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001622`
名称	SmilChr04G001622
描述	expansin-A4-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26990749 - 26993464 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020055`
GeneID	`131020055`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020055`
原始查询	`SmilChr04G001622`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-A4-like
产物	expansin-A4-like
Arabidopsis	`AT1G69530` (EXPA1) expansin A1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843288] identity=74.3; qcov=1.02; evalue=1.16e-137; confidence=high
Rice	`Os05g0477600` (OsEXP4) - identity=78; qcov=1; evalue=1.78e-143; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020055

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057804679.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057804679.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804679.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804679.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804679.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26992439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:26992529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C57,D7
`Chr4:26992605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:26992940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B54,D10,D11,D7
`Chr4:26992955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr4:26992979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr4:26993044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:26993066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:26993081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,D6
`Chr4:26993092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,C33,C42,C71
`Chr4:26993127`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C34
`Chr4:26993127`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804679.1

245 aa

122

245

DPBB_1

Expansin_C

PF03330 DPBB_1 59-143 aa PF01357 Expansin_C 154-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804679.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	59	143	3e-22	79.4	Lytic transglycolase
`XP_057804679.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	154	231	2.6e-34	117.9	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948696.1
TGGTAGTTGAAGTTGGGACAAATGCATGTGCCTCTTGGATTATAAATTTGACATTAATTTGGTGTGGCTCTCAGACTATGCAAAAAATGTCATTTTCAGCAAAATTAAATTAATCAATTGCATTCCTTCTGCCCCTTATAAATACAGCTACACTCTTACTTGAAAATCGTACAATTCAATTCCAACAATTTCTGCATCTCAAATTGTTTCATATAACATCAATGGCTGCATTGTCTCTATTAATCTTTTTCTTCTTATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020055
ATGGCTGCATTGTCTCTATTAATCTTTTTCTTCTTATTGAGGCTGAAGAATAGTTATGGAGATGGAGGATGGCAAAATGCTTATGCTACTTTCTACGGTGGAGGAGATGCATCTGGCACCATGGGAGGTGCTTGTGGGTATGGCAATCTGTACAGCCAAGGATACGGTACAAACACAGCAGCACTGAGTACTGCTCTTTTCAACAACGGGCTGAGCTGCGGCTCTTGCTACGAGTTGCGGTGCAGCAACGCCAAATCGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804679.1
MAALSLLIFFFLLRLKNSYGDGGWQNAYATFYGGGDASGTMGGACGYGNLYSQGYGTNTAALSTALFNNGLSCGSCYELRCSNAKSCLPGSITITATNFCPPNPSLPNNNGGWCNPPRQHFDMAQPAFVKIAQYRAGIVPVSFRRVACRKKGGVRFTINGHSYFNLVLISNVGGAGDVHSVSIKGSRSGWQSMSRNWGQNWQSNSYLNGQALSFRVTTSDGRTITSYNVVPSNWQFGQTFQGGQF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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