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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001645`

染色体: Chr04 坐标: 27354562-27356866 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001645`
名称	SmilChr04G001645
描述	uncharacterized SmilChr04G001645
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	27354562 - 27356866 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020074`
GeneID	`131020074`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020074`
原始查询	`SmilChr04G001645`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020074

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804712.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057804712.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057804712.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057804712.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057804712.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:27355421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr4:27355454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A4,B111,B114,C28,C30,C33,C39,C47,C72,D3
`Chr4:27355457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,C20,C3,C62
`Chr4:27355484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A16,B110
`Chr4:27355560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B7,B84,D10
`Chr4:27355582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B49,B7,B84,D10
`Chr4:27355607`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B118,B56,B72,B80,B96,C73
`Chr4:27355634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B56,B96
`Chr4:27355634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr4:27355646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C62,D3
`Chr4:27355672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr4:27355707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804712.1

466 aa

233

466

DUF1985

DUF8566

PF09331 DUF1985 3-125 aa PF29561 DUF8566 3-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804712.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	3	125	1.7e-09	38.5	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057804712.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	3	146	1.4e-07	32.2	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948729.1
TTGTGTCAGAAGAAAATGAGATGTGCTTCTTTCTGTGTGGAGCACGAGTCAGATTTTCCCCTGCGGACTACGCATTAGTGACTGGGCTCAATTTCGGGGGATCGAGGTTCGATGCGACATTACAGCACGACTGCAGTCGCGTGGAGGCATACCGACGATTCTGCGGTACGCGAAGCATGACCATACAGTCGCTTATCAAACGCGTGTGCGATTTGGATCATCGAGTGGATGATGAGGATGGGAGCCTGTACCTTCGTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020074
ATGTGCTTCTTTCTGTGTGGAGCACGAGTCAGATTTTCCCCTGCGGACTACGCATTAGTGACTGGGCTCAATTTCGGGGGATCGAGGTTCGATGCGACATTACAGCACGACTGCAGTCGCGTGGAGGCATACCGACGATTCTGCGGTACGCGAAGCATGACCATACAGTCGCTTATCAAACGCGTGTGCGATTTGGATCATCGAGTGGATGATGAGGATGGGAGCCTGTACCTTCGTGCTGTCCTCGTGTGTGTGGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804712.1
MCFFLCGARVRFSPADYALVTGLNFGGSRFDATLQHDCSRVEAYRRFCGTRSMTIQSLIKRVCDLDHRVDDEDGSLYLRAVLVCVAHTLVLGLDTRVQPWLWVLVDDLATFDRFPWGAYSYKMLCHYTHEIGTGEKYHFYGPSWALYVWALERVPGFGHMVAASSGDPTAHPRCLRWNFRGKPRLHGLRDLFEGQGGVLPLEPDGDDLSNHYFISALTPGELSVSFRPPDNPLARGVQFPQQTGARVMEERGDEEDVPRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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