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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001648`

染色体: Chr04 坐标: 27415886-27424500 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001648`
名称	SmilChr04G001648
描述	sorting nexin 2B-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	27415886 - 27424500 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020077`
GeneID	`131020077`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020077`
原始查询	`SmilChr04G001648`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sorting nexin 2B-like
产物	sorting nexin 2B-like
Arabidopsis	`AT5G07120` (SNX2b) sorting nexin 2B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830603] identity=54.8; qcov=0.991; evalue=5.33e-159; confidence=high
Rice	`Os05g0346100` - identity=65.1; qcov=0.654; evalue=1.74e-119; confidence=high
GO	GO:0035091 (phosphatidylinositol binding)
KEGG	-
Pfam	PF00787 (PX); PF09325 (Vps5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020077

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057804716.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057804715.1`
3	Endosome	内体	0.40000	`XP_057804715.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057804716.1`
5	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057804715.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:27416590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A8,B54,D10
`Chr4:27416750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr4:27416768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B65,B77,C14,C4
`Chr4:27416772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C85
`Chr4:27417062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B134,B65,B77,C4
`Chr4:27417072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:27417101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:27417176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:27417329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:27417384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr4:27424228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804715.1

564 aa

282

564

Vps5

PF00787 PX 162-245 aa PF09325 Vps5 317-531 aa

XP_057804716.1

555 aa

278

555

Vps5

PF00787 PX 162-245 aa PF09325 Vps5 317-547 aa

XP_057804717.1

451 aa

226

451

PF00787 PX 162-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804715.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	162	245	1.8e-19	70.8	PX domain
`XP_057804715.1`	Pfam	`PF09325`	Vps5	Domain	317	531	3.7e-17	63.4	Vps5 C terminal like
`XP_057804716.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	162	245	1.8e-19	70.8	PX domain
`XP_057804716.1`	Pfam	`PF09325`	Vps5	Domain	317	547	3.2e-19	70.2	Vps5 C terminal like
`XP_057804717.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	162	245	3.7e-20	73.0	PX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948732.1
ATACGGATCAGGATTTGAGTACGATACACTTGAGTGTACCCCGGAGCACCTCAACATCCAAAGAAACTCTACCATTATAAATGCACTCAACCGTCCTCTCAATATTGAACAGCTGAAGTAACTATTGAACAGCTGAAGCATGAATCGTTGGGACAAAATTGCCCCCTGAAAGCAATATATCCAAAATACACGTGTTATTTACCGTGCGAACAGCGCATCTCATCTTGTTCCTTGTAGTCCCCGTTAAGCATAAACCACCT...

XM_057948733.1
ATACGGATCAGGATTTGAGTACGATACACTTGAGTGTACCCCGGAGCACCTCAACATCCAAAGAAACTCTACCATTATAAATGCACTCAACCGTCCTCTCAATATTGAACAGCTGAAGTAACTATTGAACAGCTGAAGCATGAATCGTTGGGACAAAATTGCCCCCTGAAAGCAATATATCCAAAATACACGTGTTATTTACCGTGCGAACAGCGCATCTCATCTTGTTCCTTGTAGTCCCCGTTAAGCATAAACCACCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131020077
ATGATGGGCTATGAGAATCAGGGCTATGAAGAAGCCCGTCTCTATGCAACCAAAGAGCAAATGTCGGCTATCTTGCTCCACGATGAACCCTCGCCGTCGAACGGCTCCAAATCGTTCCCTGATGACCCTCTCTCTTCATCTTCCCACTTCGTCGAAATCCCGACCTCTGATGATACTGATCACGCGCACTCTCCCCTATCGAAACAAAACTCCAACCCCAGCCACAGCCACAGCTCAATCAATTCGATCCTTGAGCCGCC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804715.1
MMGYENQGYEEARLYATKEQMSAILLHDEPSPSNGSKSFPDDPLSSSSHFVEIPTSDDTDHAHSPLSKQNSNPSHSHSSINSILEPPSYAEAVFQSFDLDSVDSADIGGLDHSASASPSSFSTMLKISVSDPKREPEQSGSLVPGGSSYFSYLITTFTNMPEFNGTEFNVRRRFRDVVALSERLAESYRGFFIPLRPDKSVVESQVMQKNEFLEQRRAALEKYLRRLAAHPVLRGSEELRAFLEPSDRMQLMRTTDAASR...

XP_057804716.1
MMGYENQGYEEARLYATKEQMSAILLHDEPSPSNGSKSFPDDPLSSSSHFVEIPTSDDTDHAHSPLSKQNSNPSHSHSSINSILEPPSYAEAVFQSFDLDSVDSADIGGLDHSASASPSSFSTMLKISVSDPKREPEQSGSLVPGGSSYFSYLITTFTNMPEFNGTEFNVRRRFRDVVALSERLAESYRGFFIPLRPDKSVVESQVMQKNEFLEQRRAALEKYLRRLAAHPVLRGSEELRAFLEPSDRMQLMRTTDAASR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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