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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001674`

染色体: Chr04 坐标: 27748707-27755533 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001674`
名称	SmilChr04G001674
描述	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD15
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	27748707 - 27755533 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019562`
GeneID	`131019562`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019562`
原始查询	`SmilChr04G001674`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD15
产物	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD15
Arabidopsis	`AT3G17660` (AGD15) ARF-GAP domain 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821033] identity=52.7; qcov=1.05; evalue=8.94e-80; confidence=high
Rice	`Os07g0563800` (OJ1720_F04.113) - identity=50; qcov=1.03; evalue=2.32e-71; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01412 (ArfGap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019562

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804123.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804123.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804123.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804123.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804123.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:27753490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:27753546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr4:27753991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:27755280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804123.1

232 aa

116

232

ArfGap

PF01412 ArfGap 18-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804123.1`	Pfam	`PF01412`	ArfGap	Domain	18	123	5.2e-41	140.1	Putative GTPase activating protein for Arf

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100334.1
TTGAAAAATCATTTCCAAAATTCAGAGGGAGAAAGAGAGACACAACTCTCCTCAAATCAATCGTCTCTCTTTCTCTTTCTCCATCTCTGTTAATGTGATTCTTCGTGTTTCTCCCATTTTTTTCCTTCTTTTCTTTTTTTCCTTTTACATTTGTATTTTTCATTTTCTTTTTCTTTTTTCCTTTGATTTTTAGTGTGTGTATTTGTGTGTGAATCCATTCGTGACAGACATATATATTGAGAGCTATGAATGAGAAGGCG...

XR_009100336.1
TTGAAAAATCATTTCCAAAATTCAGAGGGAGAAAGAGAGACACAACTCTCCTCAAATCAATCGTCTCTCTTTCTCTTTCTCCATCTCTGTTAATGTGATTCTTCGTGTTTCTCCCATTTTTTTCCTTCTTTTCTTTTTTTCCTTTTACATTTGTATTTTTCATTTTCTTTTTCTTTTTTCCTTTGATTTTTAGTGTGTGTATTTGTGTGTGAATCCATTCGTGACAGACATATATATTGAGAGCTATGAATGAGAAGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019562
ATGAATGAGAAGGCGTTTGTTACCAAAGAGCTCAATGCCAAACATGCAAAGATACTGTTGGGTCTCCTTAAGCTGCCCGAAAACAAGGAATGTGCAGATTGCCGGAGCAAGGCTCCACGATGGGCAAGCATCAACCTTGGAATATTTATATGCATGCGATGTTCTGGAATACACCGCAGTCTTGGAGTACACATCTCGAAGGTAAGGTCTACAACGTTGGACACATGGCTTCCCGAGCAGGTTGCATTCATGCAGGTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804123.1
MNEKAFVTKELNAKHAKILLGLLKLPENKECADCRSKAPRWASINLGIFICMRCSGIHRSLGVHISKVRSTTLDTWLPEQVAFMQVMGNQKSNSYWEADLPAQFYRSPIETFIYAKYVDRRWAPTTPQPIPEICAESTSTRKEIPKKARRYSLDEEFFVKEMPKIAPPKSHCRAESFSFMDAIDSAPPLISFEGCSSSKNVDTGTDLFSLLYVSEETQDRTVVPPSRWASFE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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