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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001676`

染色体: Chr04 坐标: 27777146-27779100 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001676`
名称	SmilChr04G001676
描述	F-box protein At5g49610-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	27777146 - 27779100 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019557`
GeneID	`131019557`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019557`
原始查询	`SmilChr04G001676`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g49610-like
产物	F-box protein At5g49610-like
Arabidopsis	`AT5G07610` (AT5G07610) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830654] identity=26.3; qcov=0.961; evalue=1.7e-19; confidence=low
Rice	`Os07g0535200` (OsFbox376) - identity=27.1; qcov=0.797; evalue=2.29e-13; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3); PF24750 (b-prop_At3g26010-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019557

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804116.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057804116.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057804116.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804116.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804116.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:27777882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr4:27778018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B30,B32
`Chr4:27778026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B104,B13,B18,C55
`Chr4:27778172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B31
`Chr4:27778560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:27778668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B131
`Chr4:27778675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804116.1

408 aa

204

408

F-box

b-prop_At3g26010-like

FBA_3

FBA_1

PF00646 F-box 20-50 aa PF24750 b-prop_At3g26010-like 105-318 aa PF08268 FBA_3 108-313 aa PF07734 FBA_1 113-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804116.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	20	50	0.00043	20.8	F-box domain
`XP_057804116.1`	Pfam	`PF24750`	b-prop_At3g26010-like	Repeat	105	318	7.7e-16	58.8	F-box protein At3g26010-like, beta-propeller
`XP_057804116.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	108	313	1.3e-13	51.4	F-box associated beta propeller domain
`XP_057804116.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	113	276	2e-11	44.2	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948133.1
TCAGTGATTTCGAATTTCATATTTGTGGGAGAGACATGTGTGCACGAAACCATTGTTTTTCTTTTTCACCCATTTCTCTCAATCCCTCAGTAGAATTCGAGGCCCAAAACATTTGATCTTCATCATCCTCTCCTTTTCTCATTAATACAGACAGACATGATTTCTGAGATGAAGAAAATGAAGGGGCACTGGTTCGCTAATGATGATATCCCTATGAATATACTAAGCCGTTTGTCTACGAAGACATTGCATCTCTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019557
ATGATTTCTGAGATGAAGAAAATGAAGGGGCACTGGTTCGCTAATGATGATATCCCTATGAATATACTAAGCCGTTTGTCTACGAAGACATTGCATCTCTTCAAGTCGGTTTCCAAAGATTGGCTGAATCTCATCTCTGACCGCTCATTCATCAGCCTCCAGTTGAAAAGAAGCGAGCCCGTCTCGGGTTTTTACTTCCAGGAGGTATTTCAGTGGACTGATGATGAATATGTAGATCAATGTATTAGCTACATTAATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804116.1
MISEMKKMKGHWFANDDIPMNILSRLSTKTLHLFKSVSKDWLNLISDRSFISLQLKRSEPVSGFYFQEVFQWTDDEYVDQCISYINVGVERVNVWCNVLDFLPDNVVVLSLNNGLLCCRTSFPNSHPMIYVCNPLNKQWRSLMWPNNIAKDCSIALAFDPFRDPIDVSTDFKLVAVSRIEEGYKQILVEEDEEEEEEEEYSFFFDIYSSKTRSWRRSKECCKCNHELTKNRGVLADGILYWLVGHGYGILMFDLQNELSW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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