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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001677`

染色体: Chr04 坐标: 27779688-27781293 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001677`
名称	SmilChr04G001677
描述	uncharacterized SmilChr04G001677
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	27779688 - 27781293 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023228`
GeneID	`131023228`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023228`
原始查询	`SmilChr04G001677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=42.3; qcov=0.893; evalue=9.26e-55; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=39.5; qcov=1.18; evalue=7.21e-75; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023228

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808752.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808752.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808752.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808752.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808752.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:27779696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:27779736`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr4:27779736`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr4:27780309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr4:27780318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr4:27780332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:27780334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B88,B94,B95,C34
`Chr4:27780342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr4:27780353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A16,A20,B1,B118,B21,B22,B25,B48,B60,B76,B78,B80,B81,B95,C39,C54,C58,C6,C78
`Chr4:27780393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B88,B95,C34,D7
`Chr4:27780406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:27780440`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B95,C34,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808752.1

299 aa

150

299

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 82-127 aa PF04827 Plant_tran 153-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808752.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	82	127	5.7e-42	144.4	Plant transposon protein
`XP_057808752.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	153	228	5.7e-42	144.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952769.1
ATGCGTCGTGCGTTGTTTTTGCGTATAGTTAATGCCGTCGCATCCGATCCATACTTCCAACAACGCACGGATGGGCTTGGGAGACCCGGCTTCACACCGTTGCAGAAATGCACGGTTGTTGTTCGTATGCTAGCTAACGGTGGGGCAGCGGACCAGTACAACGAGTATCTCCAGATTGCAGAGTCCACCTCGTTGGAGTGCTTGCGTAGATTCTGTCGAGCCATTATTCACCTCTTCGGCGCGGAATACTTGAGGAGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023228
ATGCGTCGTGCGTTGTTTTTGCGTATAGTTAATGCCGTCGCATCCGATCCATACTTCCAACAACGCACGGATGGGCTTGGGAGACCCGGCTTCACACCGTTGCAGAAATGCACGGTTGTTGTTCGTATGCTAGCTAACGGTGGGGCAGCGGACCAGTACAACGAGTATCTCCAGATTGCAGAGTCCACCTCGTTGGAGTGCTTGCGTAGATTCTGTCGAGCCATTATTCACCTCTTCGGCGCGGAATACTTGAGGAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808752.1
MRRALFLRIVNAVASDPYFQQRTDGLGRPGFTPLQKCTVVVRMLANGGAADQYNEYLQIAESTSLECLRRFCRAIIHLFGAEYLRRPTSTDCQRLLAMHEAKHGFPGMLGSLDCMHWPWKNCPTAIRENRPSSSKPSHRKIYGSGMLFLGLLPVFVKSPTHPTDPKGKRFKVMQKAALKDIERAFGVLQAHWAIVKGPSRLWSKEEMSDIMFTCIILHNMIIEDEGEHATQWEEDIDEASSSAASQPRAGAPSDFRAFLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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