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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001681`

染色体: Chr04 坐标: 27830894-27831947 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001681`
名称	SmilChr04G001681
描述	probable carboxylesterase 18
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	27830894 - 27831947 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019559`
GeneID	`131019559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019559`
原始查询	`SmilChr04G001681`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable carboxylesterase 18
产物	probable carboxylesterase 18
Arabidopsis	`AT5G23530` (CXE18) carboxyesterase 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832418] identity=46.7; qcov=0.997; evalue=1.1e-110; confidence=high
Rice	`Os07g0643400` (OJ1003_C06.126) - identity=47.3; qcov=0.985; evalue=1.91e-94; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF07859 (Abhydrolase_3); PF20434 (BD-FAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057804118.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057804118.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057804118.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804118.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804118.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:27830957`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	B117,B125,B136,B38,B39,B41,B54,B57,B58,B63,B66,B75,B84,B88,B99,C13,C27,C41,C53,C55,C59
`Chr4:27830961`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	B117,B125,B136,B38,B39,B41,B54,B57,B58,B63,B66,B75,B84,B88,B99,C13,C27,C41,C53,C55,C59
`Chr4:27831255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,D3
`Chr4:27831292`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C56
`Chr4:27831292`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C56
`Chr4:27831298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr4:27831505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,D3
`Chr4:27831510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,D3
`Chr4:27831537`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B86
`Chr4:27831537`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B86
`Chr4:27831572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:27831871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804118.1

333 aa

166

333

BD-FAE

Abhydrolase_3

PF20434 BD-FAE 82-183 aa PF07859 Abhydrolase_3 89-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804118.1`	Pfam	`PF20434`	BD-FAE	Domain	82	183	1.4e-10	41.8	BD-FAE
`XP_057804118.1`	Pfam	`PF07859`	Abhydrolase_3	Domain	89	307	7.4e-59	199.7	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948135.1
GAAACCTAGAAATGGGTAACAACGAAATGAAATTGCCATTATTAACAAGATTGAAGGTGTTGATAATGGAGGTGATCATATATGTTTCCACGCGCTCCGATGGCACTCTCAACCGACGTCTCTTCAACCTCCTAAATCCCATAACATCTGCACCTGCCACCAACCACATAAACACTATCCAAATCTCCACTTCCGATGTTACAATCGAGCCCTCCCGCAACCTGTGGTTCCGCCTCTTCATCCCCACCACGCCCAACTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019559
ATGGGTAACAACGAAATGAAATTGCCATTATTAACAAGATTGAAGGTGTTGATAATGGAGGTGATCATATATGTTTCCACGCGCTCCGATGGCACTCTCAACCGACGTCTCTTCAACCTCCTAAATCCCATAACATCTGCACCTGCCACCAACCACATAAACACTATCCAAATCTCCACTTCCGATGTTACAATCGAGCCCTCCCGCAACCTGTGGTTCCGCCTCTTCATCCCCACCACGCCCAACTCCGCCTCGCTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804118.1
MGNNEMKLPLLTRLKVLIMEVIIYVSTRSDGTLNRRLFNLLNPITSAPATNHINTIQISTSDVTIEPSRNLWFRLFIPTTPNSASLPLIVYFHGGGFTMYGPDSKIIDHLCSHVAARVPAVVASVNYRLAPEHKHPAQYEDGFDALKFIDARHYDVLPANTDLAKCFIGGDSAGANIAHHVTVRAVEQAQQFGKIRIVGMLGLQPFFGGEQRTESELRLRKAPLLSTEMTDAFWREFLPEGADRDHPAANVFGGGATLQN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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