当前解析结果
SmilChr04G001682| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001682 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001682 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001682 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 27832802 - 27833926 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131019566 |
|---|---|
| GeneID | 131019566 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019566 |
| 原始查询 | SmilChr04G001682 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019566 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057804127.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804127.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057804127.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057804127.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057804127.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:27833263 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr4:27833274 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 24 | A10,B10,B110,B126,B131,B133,B16,B23,B3,B32,B33,B40,B78,C2,C20,C39,C49,C50,C64,C66,C7,C83,D10,D2 |
Chr4:27833446 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr4:27833479 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,B21,B23,B64,C73 |
Chr4:27833525 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr4:27833549 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr4:27833613 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 17 | A10,A2,A6,B111,B12,B15,B40,B46,B5,B57,B76,B82,B83,C25,C53,C6,C62 |
Chr4:27833626 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr4:27833646 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B121 |
Chr4:27833650 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B104 |
Chr4:27833650 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr4:27833667 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 84 | A1,A10,A14,A20,A21,A23,A9,B1,B101,B11,B111,B114,B117,B118,B12,B121,B128,B129,B130,B136,B139,B14,B18,B20,B21,B22,B29,B3,B31,B32,B37,B39,B41,B49,B50,B52,B57,B61,B62,B67,B68,B71,B75,B76,B79,B80,B82,B87,B88,B89,B90,B98,B99,C15,C16,C22,C23,C24,C27,C28,C3,C33,C36,C48,C5,C51,C52,C54,C55,C57,C58,C60,C61,C64,C67,C68,C69,C7,C73,C75,C79,C80,C87,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。