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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001689`

染色体: Chr04 坐标: 27936161-27939697 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001689`
名称	SmilChr04G001689
描述	uncharacterized SmilChr04G001689
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	27936161 - 27939697 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019576`
GeneID	`131019576`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019576`
原始查询	`SmilChr04G001689`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleoporin protein Ndc1-Nup protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843658]; symbol=AT1G73240; hit=AT1G73240; species=arabidopsis; confidence=high
产物	nucleoporin protein Ndc1-Nup protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843658]; symbol=AT1G73240; hit=AT1G73240; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G73240` (AT1G73240) nucleoporin protein Ndc1-Nup protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843658] identity=51.6; qcov=0.957; evalue=1.97e-163; confidence=high
Rice	`Os02g0684300` - identity=53.8; qcov=0.469; evalue=1.42e-92; confidence=medium
GO	GO:0006999 (nuclear pore organization); GO:0030674 (protein-macromolecule adaptor activity); GO:0070762 (nuclear pore transmembrane ring)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF09531 (Ndc1_Nup)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019576

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	0.80000	`XP_057804133.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057804133.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057804133.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057804133.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057804133.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:27936734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:27936981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B119
`Chr4:27938126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr4:27938363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B122,C37
`Chr4:27938383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B122,C37
`Chr4:27938679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C35
`Chr4:27939068`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C73
`Chr4:27939068`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804133.1

559 aa

280

559

Ndc1_Nup

PF09531 Ndc1_Nup 29-384 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804133.1`	Pfam	`PF09531`	Ndc1_Nup	Family	29	384	1.8e-16	60.7	Nucleoporin protein Ndc1-Nup

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948150.1
GACTTCCAAATCCAAACCAACAAAACCCCAACCCCCAATCTTCCCGCCCCCTGTCTCGCGCACACACACACACTAGCTCAAATGTCAATCTCCGCCGCCATCCACCGCAGTCTGTTCAAAGACAAGGACGGCGGCGGCGGAGCTCGAGCTCTCTCCGCCATCATCAAGCACCGGTTCCTCAGTTTCTTAATCTGGCAATCCCTCCAATCAACCCTCCTACTCTTTCTCTCCAAAACCCTTCTTCTTTCCCTCTTTACTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019576
ATGTCAATCTCCGCCGCCATCCACCGCAGTCTGTTCAAAGACAAGGACGGCGGCGGCGGAGCTCGAGCTCTCTCCGCCATCATCAAGCACCGGTTCCTCAGTTTCTTAATCTGGCAATCCCTCCAATCAACCCTCCTACTCTTTCTCTCCAAAACCCTTCTTCTTTCCCTCTTTACTAAATACCCCTTTTCTCCCATTTTTCAATCCCTAGTCTACTTCGTCTGCTTCCACGTCTCGCTCCTCATCGTCTCTGTCTCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804133.1
MSISAAIHRSLFKDKDGGGGARALSAIIKHRFLSFLIWQSLQSTLLLFLSKTLLLSLFTKYPFSPIFQSLVYFVCFHVSLLIVSVSLFFISSAHPLPFASPLEISLSFIRLIFVSGGEQSLLRTRVRVSLTFVLFVCLCAVSGAVSAISVCWGCDVYYYFDSGSSRVGALGFRGFVIGLFYGLHYVYKQRWVFRFPIIQRPPFFSYKMGLPLSIGRALRFSAVGFALSGMLSFFLPNEYKSQSSVGKFIVEQIVFYLGSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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