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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001706`

染色体: Chr04 坐标: 28199381-28202166 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001706`
名称	SmilChr04G001706
描述	putative D-cysteine desulfhydrase 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28199381 - 28202166 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019590`
GeneID	`131019590`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019590`
原始查询	`SmilChr04G001706`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative D-cysteine desulfhydrase 1, mitochondrial
产物	putative D-cysteine desulfhydrase 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G48420` (D-CDES) D-cysteine desulfhydrase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841263] identity=62.9; qcov=0.96; evalue=6.31e-170; confidence=high
Rice	`Os02g0773300` (DCD1) putative D-cysteine desulfhydrase 1, mitochondrial [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4330881] identity=71; qcov=0.897; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0019148 (D-cysteine desulfhydrase activity)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00470 (D-Amino acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00291 (PALP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019590

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804153.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057804154.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057804154.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804153.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804153.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28200446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C81
`Chr4:28200971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B88,C27,C55
`Chr4:28201419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B88,C27,C55
`Chr4:28201807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:28201819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C81
`Chr4:28201904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804153.1

405 aa

202

405

PALP

PF00291 PALP 64-379 aa

XP_057804154.1

399 aa

200

399

PALP

PF00291 PALP 64-373 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804153.1`	Pfam	`PF00291`	PALP	Family	64	379	1.5e-29	104.0	Pyridoxal-phosphate dependent enzyme
`XP_057804154.1`	Pfam	`PF00291`	PALP	Family	64	373	3.7e-31	109.3	Pyridoxal-phosphate dependent enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100349.1
GAACACATATGGAGGTGGTCAAAGATGCTAGCTGCAATTTTCCTCTCCATCCATCATGGGATCATCAATCATCACCACTAAACGCTTCTTTAATCGTAGATGCCGCGGCATGGAATTGAGCAGCTACAACCATCAATAAATCCCCTCCATTTCTCCAATTATTCACTCATCAATGCAATGGGTTCTCTGCAAGAGACTCAGCTGCCCGAGTTCGAGTTCTTGAGCAAGACGACTTACATCCCGCCTTCGTGGGCAGCACA...

XM_057948170.1
GAACACATATGGAGGTGGTCAAAGATGCTAGCTGCAATTTTCCTCTCCATCCATCATGGGATCATCAATCATCACCACTAAACGCTTCTTTAATCGTAGATGCCGCGGCATGGAATTGAGCAGCTACAACCATCAATAAATCCCCTCCATTTCTCCAATTATTCACTCATCAATGCAATGGGTTCTCTGCAAGAGACTCAGCTGCCCGAGTTCGAGTTCTTGAGCAAGACGACTTACATCCCGCCTTCGTGGGCAGCACA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019590
ATGCCGCGGCATGGAATTGAGCAGCTACAACCATCAATAAATCCCCTCCATTTCTCCAATTATTCACTCATCAATGCAATGGGTTCTCTGCAAGAGACTCAGCTGCCCGAGTTCGAGTTCTTGAGCAAGACGACTTACATCCCGCCTTCGTGGGCAGCACATCTCAATCCCACGCCTTCTCACGTCTTCTCGCTCGGACATTTTCCAACTCCAATTCACAAGTGGAACCTTCCCAACCTGCCCAACAACACCGAGGTTTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804153.1
MPRHGIEQLQPSINPLHFSNYSLINAMGSLQETQLPEFEFLSKTTYIPPSWAAHLNPTPSHVFSLGHFPTPIHKWNLPNLPNNTEVYVKRDDLSGMQLSGNKVRKLEFLAAEAVVKGADCVITIGGVQSNHCRATAVAAKYLNLDCYLILRTSKDEVNKDPGLGGNLLVERLAGARIELVSEEDYYRIGRDELTNILKKKLLSEGRKPYVIPMGGSTSLATWGYIEAVREIQQQLITKGNVGATFDDIVVACGSGCTAAG...

XP_057804154.1
MPRHGIEQLQPSINPLHFSNYSLINAMGSLQETQLPEFEFLSKTTYIPPSWAAHLNPTPSHVFSLGHFPTPIHKWNLPNLPNNTEVYVKRDDLSGMQLSGNKVRKLEFLAAEAVVKGADCVITIGGVQSNHCRATAVAAKYLNLDCYLILRTSKDEVNKDPGLGGNLLVERLAGARIELVSEEDYYRIGRDELTNILKKKLLSEGRKPYVIPMGGSTSLATWGYIEAVREIQQQLITKGNVGATFDDIVVACGSGCTAAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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