当前解析结果
SmilChr04G001714| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001714 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001714 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001714 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 28359711 - 28360749 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131019597 |
|---|---|
| GeneID | 131019597 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019597 |
| 原始查询 | SmilChr04G001714 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019597 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057804159.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057804159.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804159.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057804159.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057804159.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:28360025 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C67 |
Chr4:28360043 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B57,B88,C27,C55,C73 |
Chr4:28360066 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,B22,B53,B66,C42 |
Chr4:28360069 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B40,B83,B84,C59 |
Chr4:28360071 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C67 |
Chr4:28360077 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A21,A7,B40,B83,B84,C59,D4 |
Chr4:28360089 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 254 | A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9 |
Chr4:28360090 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 50 | A10,A11,A16,A2,A7,B102,B109,B111,B117,B119,B12,B127,B133,B134,B138,B14,B17,B18,B34,B40,B42,B43,B44,B45,B51,B56,B61,B64,B65,B8,B80,B82,B89,B96,C16,C17,C25,C28,C35,C39,C44,C49,C53,C59,C74,C78,C79,C84,C85,D11 |
Chr4:28360133 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr4:28360442 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C67 |
Chr4:28360458 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B40,B83,B84,C59 |
Chr4:28360537 |
AAC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A21,A7,B40,B84,C59,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。