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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001715`

染色体: Chr04 坐标: 28362291-28365900 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001715`
名称	SmilChr04G001715
描述	uncharacterized SmilChr04G001715
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28362291 - 28365900 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019598`
GeneID	`131019598`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019598`
原始查询	`SmilChr04G001715`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019598

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804161.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804161.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804161.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804161.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804161.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28364362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A20,A22,B1,B103,B120,B58,B74,B97,C28,C36,C85,D5
`Chr4:28364376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B136,B65,C21
`Chr4:28364394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C53
`Chr4:28364395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:28364406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:28364413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C62
`Chr4:28364421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr4:28364429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr4:28364448`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr4:28364448`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr4:28364452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C10,C39
`Chr4:28364581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804161.1

361 aa

180

361

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 141-272 aa

XP_057804162.1

361 aa

180

361

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 141-272 aa

XP_057804163.1

361 aa

180

361

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 141-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804161.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	141	272	1.7e-14	54.8	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057804162.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	141	272	1.7e-14	54.8	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057804163.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	141	272	1.7e-14	54.8	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948178.1
ACTAATGAAAATTTGCAACTAGTGTATTCTCTCTCCCTTTCCCCCTTCTCCTATACATCAATACGCACTCGCTTGAGACCAACATATGTCATCATGCACTTCAAGTCAAATGGGGCTCTTGACTATGAGATTATTCTATCCTGGTGCGTCGCTTCCTTTTGTGTCAAAGGGTTATGCACTCTTGTCTTCCCAATTTTGGTAAGCTTAAGAGGTTTGGGATTGTTGGTCTGAATGGTTGTGTTGTTTGTTTAGATGATGCT...

XM_057948179.1
ACTAATGAAAATTTGCAACTAGTGTATTCTCTCTCCCTTTCCCCCTTCTCCTATACATCAATACGCACTCGCTTGAGACCAACATATGTCATCATGCACTTCAAGTCAAATGGGGCTCTTGACTATGAGATTATTCTATCCTGGTGCGTCGCTTCCTTTTGTGTCAAAGGGTTATGCACTCTTGTCTTCCCAATTTTGACATCTCCAAGTCAACCCAAGATTGCCCCTCCATCTTATTATATATCCCTCTCAGTTAGTGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131019598
ATGTCTACTTCTGGCCGATCCGGATCTACGCATTCGACCGACGATGCGGATGTGTCCGTGACGCTGCCCACGGGGGCTATACCGACTGGTGTTGCTAAGGATGGGCGCATATGGGTGCATCTTCATGGCAGTGTTTTGAGGCCGAGTGGACCTATTCGGGCTAGGGCTACTGATAGCTTCCAAGGTATGCCAGATGCAAGTGGCACGAATTGGAAGAATTTGACTGAGGAGATGAAGGACTTGTACTTCGACGAATTTGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804161.1
MSTSGRSGSTHSTDDADVSVTLPTGAIPTGVAKDGRIWVHLHGSVLRPSGPIRARATDSFQGMPDASGTNWKNLTEEMKDLYFDEFVKAFCWQQDKYTRHQIKKAWISEARVAYNDYISACKKTLLLHKKKIESLNPIVEAAWRAYWALPETQARSAQASKNRRSEPCGVGTGMAIHHGGSRSALDHAEHLARESNIPFDAASWATFRRIHFKNGQYTAGRPAQHGLEVERRVAELREIQGEVTPADVDRIFREVVTPDP...

XP_057804162.1
MSTSGRSGSTHSTDDADVSVTLPTGAIPTGVAKDGRIWVHLHGSVLRPSGPIRARATDSFQGMPDASGTNWKNLTEEMKDLYFDEFVKAFCWQQDKYTRHQIKKAWISEARVAYNDYISACKKTLLLHKKKIESLNPIVEAAWRAYWALPETQARSAQASKNRRSEPCGVGTGMAIHHGGSRSALDHAEHLARESNIPFDAASWATFRRIHFKNGQYTAGRPAQHGLEVERRVAELREIQGEVTPADVDRIFREVVTPDP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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