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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001721`

染色体: Chr04 坐标: 28477668-28482053 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001721`
名称	SmilChr04G001721
描述	MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28477668 - 28482053 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019605`
GeneID	`131019605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019605`
原始查询	`SmilChr04G001721`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 1
产物	MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 1
Arabidopsis	`AT5G63190` (AT5G63190) MA3 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836440] identity=71.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0120500` - identity=70.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02847 (MA3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804173.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057804173.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804173.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804173.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804173.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28478230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C26,C55
`Chr4:28478249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B138,B62,B77,C26,C30
`Chr4:28478249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B62,B77,C26,C30
`Chr4:28478284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B130,B136,B51
`Chr4:28478285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:28478302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:28478345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C49,C82
`Chr4:28478368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C49,C82
`Chr4:28478411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:28480189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr4:28480268`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr4:28480268`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804173.1

712 aa

356

712

MA3

PF02847 MA3 138-248 aa PF02847 MA3 301-412 aa PF02847 MA3 437-546 aa PF02847 MA3 600-706 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804173.1`	Pfam	`PF02847`	MA3	Repeat	138	248	6.3e-127	416.7	MA3 domain
`XP_057804173.1`	Pfam	`PF02847`	MA3	Repeat	301	412	6.3e-127	416.7	MA3 domain
`XP_057804173.1`	Pfam	`PF02847`	MA3	Repeat	437	546	6.3e-127	416.7	MA3 domain
`XP_057804173.1`	Pfam	`PF02847`	MA3	Repeat	600	706	6.3e-127	416.7	MA3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948190.1
TCACATCCTAAACCCCAACGCGATTGTCGAATAAATCGTAGAGAAAAGCAGAGAACGGTACCGAAGGGAGGCTACGAAAAAACCCGCTTAAAGCGCCAAAGCCACGTGGACGCCTCATTAGGTGATGACGTGTACATGTAACCGTAGCCTCCCTATTTATTCACTTCGTTCTCATCCACTTCCCCTCTCTCTTTCTCTCACTGCAGTTTCTCTCTCGGCACAGACAAATAGATACAGATACAGTTCCCTGCACACAGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019605
ATGGCTAGCCGCGAGGGATTTCTGACGGAGGAGCAGAGGGAGATGCTGAAAATAGCGTCGCAGAATGCGGAGGTGATGTCGTCATTGTCTCTGGCGTCGTCGCCTAAATCTCCTGGCCCGAGGTCGCCCGGTCAGAACTCGTCTCTGCTGTTCGAGCACAACCATGTCAAGGCGCCTGGAGGAGGACACTCTGCCGCAGGGGGAGGCGTGGCGGTGAGGCACGTGCGTCGTTCGCACTCTGGGAAGCTTGTTAGAGTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804173.1
MASREGFLTEEQREMLKIASQNAEVMSSLSLASSPKSPGPRSPGQNSSLLFEHNHVKAPGGGHSAAGGGVAVRHVRRSHSGKLVRVKKDGAGGKGTWGKLLDTDGESFLDRNDPNYDSGEEPYELVGSTVSDPLDEYKKAVVSLVEEYFSTGDVDVAASDLRELGSSEYHPYFIKRLVSLAMDRNNKEKEMASVLLSALYADVINSAQISQGFFMLLESADDLTVDILDAVDVLALFIARAVVDDILPPAFITKARRLLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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