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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001728`

染色体: Chr04 坐标: 28518617-28519920 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001728`
名称	SmilChr04G001728
描述	uncharacterized SmilChr04G001728
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28518617 - 28519920 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019608`
GeneID	`131019608`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019608`
原始查询	`SmilChr04G001728`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839064]; symbol=AT1G24480; hit=AT1G24480; species=arabidopsis; confidence=high
产物	S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839064]; symbol=AT1G24480; hit=AT1G24480; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G24480` (AT1G24480) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839064] identity=67.1; qcov=0.89; evalue=2.16e-113; confidence=high
Rice	`Os08g0119500` - identity=65.5; qcov=0.452; evalue=5.14e-53; confidence=medium
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF08241 (Methyltransf_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019608

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057804177.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804177.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804177.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804177.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804177.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28519092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,B77,C4,C46
`Chr4:28519141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:28519159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:28519160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:28519246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:28519360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:28519369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:28519402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C77
`Chr4:28519513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B105,B112,B13,B18
`Chr4:28519606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B130,B69
`Chr4:28519630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804177.1

263 aa

132

263

Methyltransf_11

PF08241 Methyltransf_11 129-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804177.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	129	210	2.8e-09	38.2	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948194.1
GCTTGTAAAATAATACACCACTAGTATATACGATTCTTCACGCAATTGCAATCGGGCCCATTTCTATCACTTTTTTTTATTTGCCCTATTCTAGTTTCATACCTTACCCGTTTTTCTTAATTCCATGTATTCCTCTCCGTCTTCTCCCCACTTCCACACACACACAGTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACTGTGATAACAAATATAGAGTTTTCACACAGACACGCAAAATACACACACAAAAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019608
ATGCAGAAGCAGAAAACCACTCAAAATCGAAATCCAGCAATCACTAATGCAGACATGAAAACGGATTTTCAAAAACTAAGCTTCATCATCCTCAAACCTTTCATCCTCTTCATCCTCCTCTCTCTCTCCCTCTTCGCCTTCCTCTCTCTCCAAACCACCCGCCCACCCCAGCCCCCACCGGACGCCGCCCTCCCCTCCGATCTCAAGATCCGCCCCGGCTACTCCTCCTACGACGGCTACCTCCAGCGCCAGCTCAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804177.1
MQKQKTTQNRNPAITNADMKTDFQKLSFIILKPFILFILLSLSLFAFLSLQTTRPPQPPPDAALPSDLKIRPGYSSYDGYLQRQLNKTLNPKLREIWTTRDWDRKVDKFAQFFADLKRRDLLSNASRSLCIGARVGQEVAALKRVGVEDSVGIDLVPYPPLVIKGDFHHQPFGDGQFDFEFSNVFDHALYPWRFVGEIERTLRRGGVCVLHVLLSRRADKYSANDLYSVKPLEEMFKNSELIEVRSIDGFGLDTEVVFRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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