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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001737`

染色体: Chr04 坐标: 28593473-28599189 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001737`
名称	SmilChr04G001737
描述	uncharacterized SmilChr04G001737
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28593473 - 28599189 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019617`
GeneID	`131019617`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019617`
原始查询	`SmilChr04G001737`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837836]; symbol=AT1G12800; hit=AT1G12800; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837836]; symbol=AT1G12800; hit=AT1G12800; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G12800` (AT1G12800) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837836] identity=44.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os02g0115600` - identity=38.7; qcov=1.01; evalue=3.58e-148; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00575 (S1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019617

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804189.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057804189.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057804189.1`
4	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057804190.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804189.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28594354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B131,C37
`Chr4:28594431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr4:28594530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B29
`Chr4:28594531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:28594580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:28596160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B136,C32,C55,C68
`Chr4:28596193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:28596245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr4:28596474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:28596527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,C7,C76,D1
`Chr4:28596660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C57
`Chr4:28596911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804189.1

828 aa

414

828

PF00575 S1 642-712 aa

XP_057804190.1

825 aa

412

825

PF00575 S1 642-712 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804189.1`	Pfam	`PF00575`	S1	Domain	642	712	8.3e-14	52.4	S1 RNA binding domain
`XP_057804190.1`	Pfam	`PF00575`	S1	Domain	642	712	8.2e-14	52.5	S1 RNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948208.1
ATTCTTGAGGATAAATGACGACAGCTTCGTCCTTCACCTTTGTTGTTTCATTTAGTTTCTCTTCACTACTCTTCCACTTCCCTAACCAATAACTCTACATTTTCTGAAAAATTATGCCAAGCCCACAATTAATTATCTCATAGTTTATCAATCTTATCACATGAGCATCGCCTTATCTCATCAACAATGGATAGTTTCACTCTCAGAACTACCGCCAATTCCACCACTTTCTCTGCTATTCAATTCTTTCCGCAACCCGT...

XM_057948206.1
ATTCTTGAGGATAAATGACGACAGCTTCGTCCTTCACCTTTGTTGTTTCATTTAGTTTCTCTTCACTACTCTTCCACTTCCCTAACCAATAACTCTACATTTTCTGAAAAATTATGCCAAGCCCACAATTAATTATCTCATAGTTTATCAATCTTATCACATGAGCATCGCCTTATCTCATCAACAATGGATAGTTTCACTCTCAGAACTACCGCCAATTCCACCACTTTCTCTGCTATTCAATTCTTTCCGCAACCCGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131019617
ATGGATAGTTTCACTCTCAGAACTACCGCCAATTCCACCACTTTCTCTGCTATTCAATTCTTTCCGCAACCCGTTTTTCATGCCAAGAAATCCGGAATTCTGAATTTCCCTTGCAGGAAATTCTGGGTTTCTGCATCAAAAGATGAACCGCAGCTTGACGAGTGGGATAAGATGGAGCTTAAATTTGGTCGAATGATTGGGGAAGACCCCAAAATCACTTTAGCCAAGATAATGGGTAGAAAATCAAATCCAGATGTGTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804189.1
MDSFTLRTTANSTTFSAIQFFPQPVFHAKKSGILNFPCRKFWVSASKDEPQLDEWDKMELKFGRMIGEDPKITLAKIMGRKSNPDVSYLEIERLLDKKKGSALDEDVEEVPFDFPDQKKSVKSVQGLNLVRPVLKKGAKFEATAKPVETSAKSSIRPIKKDSEVTKSSVPDVILRKPRSFNEDDGASGSTRFGMRPNLSLRMGKEPQKERFSDTTLLRKPEPMTSKSEVGEENSREDSFDGSYGSSSTEGRGSAPLLKKP...

XP_057804190.1
MDSFTLRTTANSTTFSAIQFFPQPVFHAKKSGILNFPCRKFWVSASKDEPQLDEWDKMELKFGRMIGEDPKITLAKIMGRKSNPDVSYLEIERLLDKKKGSALDEDVEEVPFDFPDQKKSVKSVQGLNLVRPVLKKGAKFEATAKPVETSAKSSIRPIKKDSEVTKSSVPDVILRKPRSFNEDDGASGSTRFGMRPNLSLRMGKEPQKERFSDTTLLRKPEPMTSKSEVGEENSREDSFDGSYGSSSTEGRGSAPLLKKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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