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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001750`

染色体: Chr04 坐标: 28819593-28821709 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001750`
名称	SmilChr04G001750
描述	pto-interacting protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28819593 - 28821709 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019631`
GeneID	`131019631`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019631`
原始查询	`SmilChr04G001750`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pto-interacting protein 1-like
产物	pto-interacting protein 1-like
Arabidopsis	`AT1G48210` (AT1G48210) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841241] identity=48.9; qcov=0.77; evalue=4.45e-92; confidence=high
Rice	`Os05g0135800` (RLCK178) - identity=50.1; qcov=0.761; evalue=1.62e-87; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019631

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804206.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057804206.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804206.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804206.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804206.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28819986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:28819993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:28820313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B137
`Chr4:28820999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C87
`Chr4:28821432`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C19
`Chr4:28821432`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804206.1

427 aa

214

427

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 152-410 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 153-417 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804206.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	152	410	1.5e-25	90.8	Protein kinase domain
`XP_057804206.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	153	417	4e-36	125.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948223.1
TTTTGACCCAAGCTATTTTACCAGCGGCAGACTTACTAAGGCCAGTGACACTTATGCTTTTGGGGTAATTTTATTGGAGGTGTTGAGTGGGAGACCAGCGGTTGAGCAAAGGCTTGGTGAGGATGAGTTGTGTATGAGAATGTGGGCTCTGGATAAAATTCAAAATGGAAAAGCTGAGCAGATTGTAGCTTCGAATTTGAAGGGAGATATCTCAGAAGATTGCCTCAAGACATTTGTTGGGGTTGCTAAAAGATGTTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019631
ATGAGAATGTGGGCTCTGGATAAAATTCAAAATGGAAAAGCTGAGCAGATTGTAGCTTCGAATTTGAAGGGAGATATCTCAGAAGATTGCCTCAAGACATTTGTTGGGGTTGCTAAAAGATGTTTGCATCGTCAACCAAAGAAACGACTCACAATGACCGGAGCTGTAGCCCAGCTTGAGTTAGCCCTTGAACAACAGGAGAGGAAAGGGATGACAACACATAAATCACAACTTTGGCCATTTTGGAATAGAGTTATACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804206.1
MRMWALDKIQNGKAEQIVASNLKGDISEDCLKTFVGVAKRCLHRQPKKRLTMTGAVAQLELALEQQERKGMTTHKSQLWPFWNRVIPSASTQKDEINEVEDEMQPIAPPSLRVNHTVNMVPIYVPSIPLAEIMDITDDFSRNSFISNGYRGRGSVFHGVLKSGQGAAIKRFYLLREHELIAQISTVSRLKHENVVKLVGYCLDTGLKVLVYEFAPRGSLHDILHGRRQGMKGLELESCPALSWSQRIKIAVGVARGLSYI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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