当前解析结果
SmilChr04G001753| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001753 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001753 |
| 描述 | UDP-glycosyltransferase TURAN-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 28845590 - 28848768 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131019640 |
|---|---|
| GeneID | 131019640 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019640 |
| 原始查询 | SmilChr04G001753 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-glycosyltransferase TURAN-like |
| 产物 | UDP-glycosyltransferase TURAN-like |
| Arabidopsis | AT1G16570 (AT1G16570)UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838227] identity=75.6; qcov=0.976; evalue=9.75e-62; confidence=high |
| Rice | Os03g0180700- identity=75.2; qcov=0.96; evalue=1.01e-60; confidence=high |
| GO | GO:0000030 (mannosyltransferase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006486 (GO:0006486) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13692 (Glyco_trans_1_4) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019640 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057804214.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057804214.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057804214.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804214.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057804214.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:28845649 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr4:28846110 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B65 |
Chr4:28848248 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B69,B73,B82,C81 |
Chr4:28848336 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057804214.1PF13692
Glyco_trans_1_4 6-79 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057804214.1 |
Pfam | PF13692 |
Glyco_trans_1_4 | Domain | 6 | 79 | 3.6e-06 | 28.0 | Glycosyl transferases group 1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。