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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001756`

染色体: Chr04 坐标: 28891818-28893873 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001756`
名称	SmilChr04G001756
描述	28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28891818 - 28893873 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019636`
GeneID	`131019636`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019636`
原始查询	`SmilChr04G001756`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic-like
产物	28 kDa ribonucleoprotein%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G24770` (RBP31) 31-kDa RNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828579] identity=68.5; qcov=0.68; evalue=2.1e-84; confidence=high
Rice	`Os09g0565200` - identity=67.9; qcov=0.68; evalue=3.42e-88; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019636

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804209.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057804209.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804209.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804209.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804209.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28891936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,D3
`Chr4:28891939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B58,C41,C57,C78
`Chr4:28891948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B22,B8,C25
`Chr4:28891984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:28891986`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B115,B139
`Chr4:28891986`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B115,B139
`Chr4:28892027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,D3
`Chr4:28892032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,D3
`Chr4:28892067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B37,B84,C30
`Chr4:28892091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B37
`Chr4:28892095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B37
`Chr4:28892098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804209.1

275 aa

138

275

RRM_1

PF00076 RRM_1 105-174 aa PF00076 RRM_1 192-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804209.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	105	174	3e-42	143.0	RNA recognition motif
`XP_057804209.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	192	262	3e-42	143.0	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948226.1
ATTTCACTTTTCAAAACCCTTCGAACCCAATTCTGTCGCTCTCTCCAAATTGATAATTCTCAGAGAAAAATGGCTTTTGCTGCAAAATCTACAAATGGCTGCCTAGCTTCTTCACTCCCATCACTCTTCACAGCTTCAAAAGCTTCATACTCACACCCTTTTCCGTCAATACGCATCAAACCCATCAAATTACAAATTTCTTGCTCTTGCGCTTCCTCAATTCCACTATCACCTATTTTGAGGGTTTCTGTCATCGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019636
ATGGCTTTTGCTGCAAAATCTACAAATGGCTGCCTAGCTTCTTCACTCCCATCACTCTTCACAGCTTCAAAAGCTTCATACTCACACCCTTTTCCGTCAATACGCATCAAACCCATCAAATTACAAATTTCTTGCTCTTGCGCTTCCTCAATTCCACTATCACCTATTTTGAGGGTTTCTGTCATCGCCGCTCAGCAAGAAGAGGACAGCCCTGTTCTCCTCGAGGAGCAAGACGGCAGAGATTTCAGCTGGGCTGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804209.1
MAFAAKSTNGCLASSLPSLFTASKASYSHPFPSIRIKPIKLQISCSCASSIPLSPILRVSVIAAQQEEDSPVLLEEQDGRDFSWAEAPDSGETDVFVEPPEEAKLYVGNLPYDVDGVSLAQIFKGAGTVEIVNIICNRETEQSRGFGFVTMSSVVEAEKAVEMFNRYDLNGRLLTVSKAAKRGSKPPARYRIYVGNLPWSVDDARLQQVFSEYGKVVSARVLTDRENGRSRGFGFVVMSSEAELNDAIANLDGMSLDGRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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