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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001757`

染色体: Chr04 坐标: 28893823-28894741 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001757`
名称	SmilChr04G001757
描述	uncharacterized SmilChr04G001757
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28893823 - 28894741 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019639`
GeneID	`131019639`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019639`
原始查询	`SmilChr04G001757`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01135 (PCMT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019639

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804213.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804213.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804213.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804213.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804213.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28893910`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C23,C82
`Chr4:28893910`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C23,C82
`Chr4:28893926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B21,B54
`Chr4:28894034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C13
`Chr4:28894084`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	35	A20,A22,A25,B1,B103,B110,B120,B122,B125,B19,B2,B21,B54,B58,B59,B74,B76,B86,B90,B92,B93,B95,B97,B99,C15,C19,C25,C28,C36,C37,C39,C50,C67,C87,D5
`Chr4:28894105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B30,C56
`Chr4:28894147`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B123,B25,B51,B65,B77,C4,C46,D7
`Chr4:28894293`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B123,B25,B65,B77,C4,C46
`Chr4:28894330`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B123,B65,C4
`Chr4:28894330`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B123,B65,C4
`Chr4:28894346`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B117,B129,B31,B61,B72,B8,C29,C5,C57,C75
`Chr4:28894385`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B65,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804213.1

136 aa

136

PCMT

PF01135 PCMT 46-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804213.1`	Pfam	`PF01135`	PCMT	Family	46	69	1.1e-05	26.0	Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase (PCMT)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948230.1
AAACAGTAAGTGGCATTTAGATTTAATTTAGGGCATTCTAATTTGATTGTAATATGTTTACATAGAGAAATGTTATACTACATTTTTATACTTATGTGAACATCACTAACGTAACCATGTTAATTTATACATAAATGAGTATTTTGAAGGGCTAATAGGAAGAGTCAAATCGATCACAGAACAACCGACCACATCTCTAGATAGGCCTGAGTTACAACGTGGCTGCATTAGCAGAGCTGGACAGATGATAAAAAAAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019639
ATGGTGCAGCAGCAGCAGCAGAGTTATGGAATTATGCAGTCAAAGAAAAGGGCACAAGTGACAGGGGTTTGTTTGTTCCAGAGGGCACACCCCCATACATTGACAGATCGTCTACAACGCACCTCACATGCACGCCATGCGGGATGGCCAGACTTTGCGCCTTACAACACCATTCACATCGGAGCTGCCACACCAGAAATTCCCCCCAGCGCTTATCGAACAACTGAAACCCGCTGGCAGATTGGTGATCCCTGTTGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804213.1
MVQQQQQSYGIMQSKKRAQVTGVCLFQRAHPHTLTDRLQRTSHARHAGWPDFAPYNTIHIGAATPEIPPSAYRTTETRWQIGDPCWERIRGTESCGQERRWHVQYPERDGCLLHASATAALGVLTLRACRVYIYDN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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