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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001758`

染色体: Chr04 坐标: 28895038-28898509 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001758`
名称	SmilChr04G001758
描述	protein-L-isoaspartate O-methyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28895038 - 28898509 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019637`
GeneID	`131019637`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019637`
原始查询	`SmilChr04G001758`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein-L-isoaspartate O-methyltransferase 1-like
产物	protein-L-isoaspartate O-methyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT3G48330` (PIMT1) protein-l-isoaspartate methyltransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823991] identity=72; qcov=1; evalue=1.82e-126; confidence=high
Rice	`Os08g0557000` (PIMT1) - identity=75; qcov=0.978; evalue=1.79e-124; confidence=high
GO	GO:0004719 (protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0036211 (protein modification process)
KEGG	-
Pfam	PF01135 (PCMT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019637

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804211.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804211.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804211.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804211.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804211.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28895218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,C10,C7,C79
`Chr4:28895220`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B19,B61
`Chr4:28895220`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B19,B61
`Chr4:28895443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C37,C50,C87
`Chr4:28895758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B18,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804211.1

229 aa

114

229

PCMT

PF01135 PCMT 12-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804211.1`	Pfam	`PF01135`	PCMT	Family	12	223	5.4e-85	285.2	Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase (PCMT)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948228.1
AATTCTGCTAATCATCTCTCTCACATTCTCAAACACTGTAAAAATCAATTATCATAGTATATCTCAATTTTTGCCCCAATTAACGGGCTACTCAATTCTGTAATTCTCATTTAAAAGACTACTCAAAACTCGAATTCTCTTTATTGGGACTCCCAACAATTGGAGAAACTAGTTCGATTTTTAAACAGAGTCCACCTCTTTGTGCCGTCGGATTTGACTATTTTGTGGTCGAAATTTAAATTTAAATTGCCGTTGCCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019637
ATGGAGCAATACTGGAGAGGAAGCAGTATCAATAAGGAGGGAATGGTGCAGCACTTGCAGAGTTATGGGATTATAAAATCAAAGAAAGTGGCAGAAGTGATGGAAACCATTGACAGGGGTTTGTTTGTTCCAGAGGGCACACCCCCATATGTTGATAGTCCTATGCAGATCGGCTACAACGCCACTATCTCCGCACCTCACATGCACGCCATGTGCCTCGAGCTGTTGGAGAACCATCTCAAACCCGGCATGCATGCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804211.1
MEQYWRGSSINKEGMVQHLQSYGIIKSKKVAEVMETIDRGLFVPEGTPPYVDSPMQIGYNATISAPHMHAMCLELLENHLKPGMHALDVGSGTGYLTACFAVMVGAQGRTVGVEHIPELAEFSIKNIEKSAAAPLFKEGSFSIHVADGRQGWPEFAPYDAIHVGAAAPEIPPALIEQLKPGGRLVIPVGNVSQELKVVDKNADSTLNIQSETAVRYVPLTSREAQLQGR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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