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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001760`

染色体: Chr04 坐标: 28931560-28934161 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001760`
名称	SmilChr04G001760
描述	leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine/tyrosine-protein kinase SOBIR1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28931560 - 28934161 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019629`
GeneID	`131019629`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019629`
原始查询	`SmilChr04G001760`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine/tyrosine-protein kinase SOBIR1
产物	leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine/tyrosine-protein kinase SOBIR1
Arabidopsis	`AT2G31880` (SOBIR1) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817746] identity=56.5; qcov=0.877; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0288100` (PK) - identity=51.3; qcov=0.617; evalue=7.88e-147; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019629

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804204.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804204.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804204.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804204.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804204.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28931702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:28931705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:28931751`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr4:28931751`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr4:28931817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:28931834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:28931896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:28931955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C82
`Chr4:28931965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr4:28932054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C24
`Chr4:28932117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,C13
`Chr4:28932480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B77,C23,C46,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804204.1

726 aa

363

726

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00560 LRR_1 187-207 aa PF00560 LRR_1 234-255 aa PF00069 Pkinase 435-714 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 436-670 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804204.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	187	207	4.1e-12	44.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057804204.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	234	255	4.1e-12	44.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057804204.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	435	714	1.2e-43	150.2	Protein kinase domain
`XP_057804204.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	436	670	1.5e-37	130.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948221.1
TTCCTCCATGTGAGGTGAGAGATCTGAAACTATGACTATGAGTAATAGATTTCACTTTTACGTTAAATAAAATAATTTTATTTATATTTTATTTATAAAATTAGAACATAGTTATTTTTTTGGTTAAATTTTCTTATGAGGGCCAGTTTGGTAATATTGTACAAGTCAACCTATGACGTCAATTTTGGAGCTAAGTCCTCCGCCCCAAATTCTTTCACACGGCATCCACGACCACGATTGCACAATAAAAACACACAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019629
ATGAGGGCCAGTTTGGTAATATTGTACAAGTCAACCTATGACGTCAATTTTGGAGCTAAGTCCTCCGCCCCAAATTCTTTCACACGGCATCCACGACCACGATTGCACAATAAAAACACACAGCCACCACACAAAACTCCGGCAGCCTCCAACCACCACAACTTCCACCGCTGGCGGCAACGACCAGCAGCAGCAATGGCTCCGACTCCATCCAAATGCCACCTCTTTCTCCTCCACTTCACCACACTCATCCTCCTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804204.1
MRASLVILYKSTYDVNFGAKSSAPNSFTRHPRPRLHNKNTQPPHKTPAASNHHNFHRWRQRPAAAMAPTPSKCHLFLLHFTTLILLVQSRPPTLLRSDLEALLLIHKDLGFRRSPAANPCDSAGILCERRSVNTSHTLRITGLVFESQQLDGRLSPAISKLTELKQLSLQDNNLFDQIPAQIVECKKLEILDLRNNQFSGQIPLGLSWLIRLRVLDLSGNMFTGNLKFLKHFPNLEKLNLADNMFAGTVPASLRSFRNLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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