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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001764`

染色体: Chr04 坐标: 28993362-28995853 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001764`
名称	SmilChr04G001764
描述	protein argonaute 4A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28993362 - 28995853 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023247`
GeneID	`131023247`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023247`
原始查询	`SmilChr04G001764`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein argonaute 4A-like
产物	protein argonaute 4A-like
Arabidopsis	`AT5G21150` (AGO9) Argonaute family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832241] identity=47.8; qcov=1.03; evalue=4.63e-146; confidence=high
Rice	`Os01g0275600` (OsAGO4a) - identity=50.9; qcov=1.01; evalue=1.28e-155; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0035194 (regulatory ncRNA-mediated post-transcriptional gene silencing)
KEGG	-
Pfam	PF02171 (Piwi)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023247

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808771.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057808771.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808771.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057808771.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808771.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28993366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,C3,C81
`Chr4:28993793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr4:28994113`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B105,B112,B18
`Chr4:28994113`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B105,B112,B18
`Chr4:28994360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B75
`Chr4:28994418`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B24,C61
`Chr4:28994418`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B24,C61
`Chr4:28994434`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B112,B118,B132,B137,B62,B67,C11,C39,C65,C69,C9
`Chr4:28994578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B131,B140,B22,C48
`Chr4:28994585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B69,C83
`Chr4:28994707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B47
`Chr4:28995318`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	32	A11,A2,A23,A8,B107,B127,B140,B28,B30,B40,B42,B43,B45,B56,B6,B63,B69,B71,B93,B96,B98,C34,C53,C62,C67,C79,C8,C80,C83,C84,C85,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808771.1

421 aa

210

421

Piwi

PF02171 Piwi 89-394 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808771.1`	Pfam	`PF02171`	Piwi	Domain	89	394	4.4e-80	269.9	Piwi domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952788.1
ATGGGGAGCAGATTATACCTAGAAATGAAACTCCTGGAGCCAAAGAAACTCGAGAATTGGGTGGTGGTGAACTTCTCCACTAGCTGTGATGTTCGTAACATGTTTATGGAGTTTGCCAAAGTCGCCTCAGCTAAAGGAATGGTTACGAGTCCTCCAGCGTGTGTTCTTGATGAAAATCCTAAAAATAGAAAGAAACCGCCTTCTGTTAGAGTCGATATGATGTTCCAACAATTGCAGTCAAGATTCAAGCACCATCCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023247
ATGGGGAGCAGATTATACCTAGAAATGAAACTCCTGGAGCCAAAGAAACTCGAGAATTGGGTGGTGGTGAACTTCTCCACTAGCTGTGATGTTCGTAACATGTTTATGGAGTTTGCCAAAGTCGCCTCAGCTAAAGGAATGGTTACGAGTCCTCCAGCGTGTGTTCTTGATGAAAATCCTAAAAATAGAAAGAAACCGCCTTCTGTTAGAGTCGATATGATGTTCCAACAATTGCAGTCAAGATTCAAGCACCATCCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808771.1
MGSRLYLEMKLLEPKKLENWVVVNFSTSCDVRNMFMEFAKVASAKGMVTSPPACVLDENPKNRKKPPSVRVDMMFQQLQSRFKHHPPNFIICLLSDKKFSDLYGPWKRKTLIEFGIQNQCLSTSKIDELYLINLLLKINIKLGGLNHAIVSESTRTIPLVSKIPTMILGIHVSHARAEAPSIASVVGSREWPRVSSYCASLRALPPKSQMIDSLFMPISKQMDAGIMRELLREFHSSSGQKKPAQIIIFRNGLSTSQFKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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