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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001768`

染色体: Chr04 坐标: 29080188-29081646 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001768`
名称	SmilChr04G001768
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29080188 - 29081646 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023249`
GeneID	`131023249`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023249`
原始查询	`SmilChr04G001768`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G59218` (AT1G59218) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842234] identity=26.4; qcov=1.07; evalue=8.48e-20; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=27.1; qcov=1.06; evalue=1.53e-23; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023249

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808773.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808773.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808773.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057808773.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808773.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29080200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:29080216`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B75
`Chr4:29080216`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B75
`Chr4:29080456`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	53	A10,A23,A8,B101,B107,B108,B113,B114,B119,B13,B133,B137,B140,B16,B2,B20,B23,B24,B28,B30,B32,B42,B48,B49,B50,B56,B6,B64,B68,B71,B85,B87,B96,B99,C11,C25,C27,C32,C34,C36,C47,C48,C60,C61,C62,C63,C64,C67,C68,C69,C8,C87,D2
`Chr4:29080460`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C23
`Chr4:29080460`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C23
`Chr4:29080466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:29080482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B129,B54,B61,B8
`Chr4:29080488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B129,B54,B61,B8
`Chr4:29080533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B129,B54,B61
`Chr4:29080545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B129,B54,B61
`Chr4:29080547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808773.1

453 aa

226

453

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 14-55 aa PF23598 LRR_14 136-442 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808773.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	14	55	1.7e-11	44.7	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057808773.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	136	442	1.3e-21	77.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952790.1
ATGCCTTATCATCTGAGGGCCTGCTTTCTCTATTTGGGAATATTTCCTCGCAAGTCCAAGTTCTCCGTTTCGAAATTGGCCCACATGTGGATTGCAGAAGGATTTATACCACGCAAGGATGGTGTCACCTTGGAAGAGACCGCAGAAGAGTATTTGAAGGAGCTAAATCCGCATGCTGATGGGGAGAACTTTCTCCAGGAATTCAGGAATTCTGGGCCAGAAGGATTCTATCCTCCAATCGATGAGGTGAAGAAAAATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023249
ATGCCTTATCATCTGAGGGCCTGCTTTCTCTATTTGGGAATATTTCCTCGCAAGTCCAAGTTCTCCGTTTCGAAATTGGCCCACATGTGGATTGCAGAAGGATTTATACCACGCAAGGATGGTGTCACCTTGGAAGAGACCGCAGAAGAGTATTTGAAGGAGCTAAATCCGCATGCTGATGGGGAGAACTTTCTCCAGGAATTCAGGAATTCTGGGCCAGAAGGATTCTATCCTCCAATCGATGAGGTGAAGAAAAATCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808773.1
MPYHLRACFLYLGIFPRKSKFSVSKLAHMWIAEGFIPRKDGVTLEETAEEYLKELNPHADGENFLQEFRNSGPEGFYPPIDEVKKNRRVCIHAHISKFIETLISSRHQTLKIGLRSFVSHSDTEVTLHGKNISIIRAAFKLLRVLDAKPIKVNKIHSDLCLLVHLRYVTLSLNGDVLPEAISKLRNMQTLTVHTTSCTLKIEADILKMVELRHFQTNASATLPKKSKASEEDERLQTLCGISPKSCTQEFFSKLPNLKKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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