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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001770`

染色体: Chr04 坐标: 29093891-29095593 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001770`
名称	SmilChr04G001770
描述	vignain-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29093891 - 29095593 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019646`
GeneID	`131019646`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019646`
原始查询	`SmilChr04G001770`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vignain-like
产物	vignain-like
Arabidopsis	`AT5G50260` (CEP1) Cysteine proteinases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835091] identity=65.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0556900` (CP) - identity=63.4; qcov=0.909; evalue=2.71e-155; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0005615 (GO:0005615); GO:0005764 (lysosome); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	-
Pfam	PF00112 (Peptidase_C1); PF08246 (Inhibitor_I29)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019646

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057804216.1`
2	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057804216.1`
3	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057804216.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804216.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804216.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29094134`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C57
`Chr4:29094134`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C57
`Chr4:29094563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr4:29094909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:29095297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:29095338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B69,C83
`Chr4:29095380`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C33
`Chr4:29095380`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C33
`Chr4:29095411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B42,B43
`Chr4:29095411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr4:29095474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:29095532`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C33,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804216.1

361 aa

180

361

Inhibitor_I29

Peptidase_C1

PF08246 Inhibitor_I29 38-93 aa PF00112 Peptidase_C1 126-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804216.1`	Pfam	`PF08246`	Inhibitor_I29	Domain	38	93	6e-14	52.8	Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)
`XP_057804216.1`	Pfam	`PF00112`	Peptidase_C1	Domain	126	342	3.1e-84	283.2	Papain family cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948233.1
CCCTAACCAAACACACTCATCACAAAAATCCCATCACATTCTTGAAAATAAAAATAAAAAATGAAGTTGTTCTTCCTAGCGACGCTCTCGCTGCTCGTGATCATCGGTTTCGTGGAGAGCTTCGACTTCCACGAGGCCGAGCTGGAGACGGAGGAACGGCTGTGGGACCTCTACGAGCGGTGGCGGAGCCACCACACAGTGACGAGGAGCCTCAACGACAAACACAAGCGTTACAACGTGTTCAAGGCCAATGCCCATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019646
ATGAAGTTGTTCTTCCTAGCGACGCTCTCGCTGCTCGTGATCATCGGTTTCGTGGAGAGCTTCGACTTCCACGAGGCCGAGCTGGAGACGGAGGAACGGCTGTGGGACCTCTACGAGCGGTGGCGGAGCCACCACACAGTGACGAGGAGCCTCAACGACAAACACAAGCGTTACAACGTGTTCAAGGCCAATGCCCATTACATCAAAGACTTCAACAAGATGGATAAGCCCTACAAGCTCAAACTCAACAAGTTTGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804216.1
MKLFFLATLSLLVIIGFVESFDFHEAELETEERLWDLYERWRSHHTVTRSLNDKHKRYNVFKANAHYIKDFNKMDKPYKLKLNKFADMTNHEFRSIYAGSKVKHNRMFQGNLRANGGFMYEDVQNVPTSIDWRKKGAVTAVKDQGNCGSCWAFSTVVAVEGINYIKTKKLVSLSEQELVDCDTVLNEGCNGGLMDIAFDYIEKNGGLTTEKIYPYTAKDGQCDMKKAKCPAVAIDGHENVPANDEGALLKAVANQPVSVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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