当前解析结果
SmilChr04G001780| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001780 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001780 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001780 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 29219303 - 29221123 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131019655 |
|---|---|
| GeneID | 131019655 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019655 |
| 原始查询 | SmilChr04G001780 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019655 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057804226.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057804226.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804226.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057804226.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057804226.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:29220445 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 16 | A19,A2,A22,A4,B1,B117,B123,B16,B17,B53,B70,B94,C59,C8,D6,D7 |
Chr4:29220452 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 18 | A23,B108,B120,B126,B13,B22,B36,B45,B58,B69,B75,B8,B89,C10,C17,C27,C39,C48 |
Chr4:29220482 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A6,B125,B85,C87 |
Chr4:29220489 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr4:29220500 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr4:29220518 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B35,C33,C5 |
Chr4:29220523 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B121,B66,C2,C30,C33 |
Chr4:29220524 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B34,C85,D10 |
Chr4:29220524 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B34,C85,D10 |
Chr4:29220548 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B140,B59,C82 |
Chr4:29220605 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,C33,C5 |
Chr4:29220608 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 24 | A25,A4,A9,B122,B2,B21,B54,B59,B76,B78,B86,B93,B95,B99,C15,C19,C25,C30,C31,C35,C45,C46,C53,C74 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。