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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001783`

染色体: Chr04 坐标: 29240628-29248178 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001783`
名称	SmilChr04G001783
描述	uncharacterized SmilChr04G001783
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29240628 - 29248178 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019658`
GeneID	`131019658`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019658`
原始查询	`SmilChr04G001783`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821042]; symbol=AT3G17740; hit=AT3G17740; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821042]; symbol=AT3G17740; hit=AT3G17740; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G17740` (AT3G17740) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821042] identity=53.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0772500` - identity=48.7; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0006396 (RNA processing); GO:0035194 (regulatory ncRNA-mediated post-transcriptional gene silencing); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome); GO:1902369 (negative regulation of RNA catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF08424 (NRDE-2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019658

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804229.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804229.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804229.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804229.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804229.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29241156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr4:29242541`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B84,D1,D5
`Chr4:29242541`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B84,D1,D5
`Chr4:29242666`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	59	A3,B1,B110,B112,B115,B118,B122,B126,B127,B13,B131,B134,B135,B16,B17,B18,B20,B3,B44,B50,B54,B56,B60,B64,B7,B71,B74,B82,B86,B87,B96,B98,B99,C10,C11,C13,C18,C19,C2,C22,C28,C33,C39,C40,C41,C43,C47,C48,C50,C61,C62,C69,C79,C80,C82,C84,C9,D5,D8
`Chr4:29242728`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A9,B118,B52,B84,B86,B93,C11,C19,C21,C22,C55,C69,D1
`Chr4:29242848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B29
`Chr4:29243349`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B42
`Chr4:29243458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C48
`Chr4:29243461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:29244390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr4:29244424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B75,C13,C41,C67
`Chr4:29246876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B38,B39,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804229.1

1144 aa

572

1144

NRDE-2

PF08424 NRDE-2 274-664 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804229.1`	Pfam	`PF08424`	NRDE-2	Family	274	664	2e-74	251.3	NRDE-2, necessary for RNA interference

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948246.1
TTAAAATCACCTAAAATAATTTCTCAAGCTCTATTGGATATGGCGGAAGAGGACCAAACTACCAAAACGACGCCGCTCTTCGCCGCTTTCGCCGGCGTTGCCGCCACTGATAGTGGCAACAACGATACGGCGAAATGGCTGCAGAACTCCAGCTTCAACACCGACCTCTCCGTCATAAACGACGCCGTTGCCAAATACAACCTCACCTACGATGAGGAACCGGAGGAAGAAGAAGACGCAGCGGAAGAAATTAATGCCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019658
ATGGCGGAAGAGGACCAAACTACCAAAACGACGCCGCTCTTCGCCGCTTTCGCCGGCGTTGCCGCCACTGATAGTGGCAACAACGATACGGCGAAATGGCTGCAGAACTCCAGCTTCAACACCGACCTCTCCGTCATAAACGACGCCGTTGCCAAATACAACCTCACCTACGATGAGGAACCGGAGGAAGAAGAAGACGCAGCGGAAGAAATTAATGCCAGGAAACGGCCGCCGCAGTACGAGATGGTGCCGTCGGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804229.1
MAEEDQTTKTTPLFAAFAGVAATDSGNNDTAKWLQNSSFNTDLSVINDAVAKYNLTYDEEPEEEEDAAEEINARKRPPQYEMVPSDASASSDEDLRRKSKKKKKRRKEESSASRASFSYAATLSSTSRKPGVEKWASSPTANEKEYYFDSRGDRDNLAFGSIYRMDVARYKLYNSKKVSGQNFFQRNKRACRLEGDNDVDALDSKLRSGGRYWSVKYAAIERHKDLKRMRVLAPRNHVKSSVADYIPLVDEGSDSGRVSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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