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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001785`

染色体: Chr04 坐标: 29264863-29273434 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001785`
名称	SmilChr04G001785
描述	homeobox-leucine zipper protein HAT5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29264863 - 29273434 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023254`
GeneID	`131023254`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023254`
原始查询	`SmilChr04G001785`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-leucine zipper protein HAT5-like
产物	homeobox-leucine zipper protein HAT5-like
Arabidopsis	`AT3G01220` (HB20) homeobox protein 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821232] identity=37.5; qcov=0.684; evalue=2.05e-06; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023254

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808779.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808779.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808779.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808779.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808779.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29273281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B63
`Chr4:29273291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B88,C27,C55
`Chr4:29273300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B101,B128,C33
`Chr4:29273300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B128,C33
`Chr4:29273324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:29273340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,D6
`Chr4:29273347`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	31	A1,A15,A16,A2,A7,A8,B106,B126,B130,B140,B27,B42,B43,B51,B70,B82,B84,B9,B91,C14,C16,C33,C43,C47,C52,C56,C60,C65,C70,C80,C86
`Chr4:29273424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808779.1

117 aa

117

Homeodomain

PF00046 Homeodomain 4-54 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808779.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	4	54	4e-10	40.1	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952796.1
ATGGCAAAACGATTTGAAGAGCATCAAATTAAGGCTCTTAGGTCAGCATTTGAAGCTTCCGATCGCTTAACTAAATCGAGAAAAAACGAATTGGCAGAGGCCACGGGGCTGGATGTTGAACAAGTTTCGAGCTGGTTTAGTCGGGAGCGGGCTGGTAAAAAAGCTCGGGAGTCAGTATTTCTCCTCGAATTTGACTACTTGAGGCTCCAAGAAGCCCTAAGGCTTAGTCTTGAGAGGGAGAACGTTCTTCAACTCGAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023254
ATGGCAAAACGATTTGAAGAGCATCAAATTAAGGCTCTTAGGTCAGCATTTGAAGCTTCCGATCGCTTAACTAAATCGAGAAAAAACGAATTGGCAGAGGCCACGGGGCTGGATGTTGAACAAGTTTCGAGCTGGTTTAGTCGGGAGCGGGCTGGTAAAAAAGCTCGGGAGTCAGTATTTCTCCTCGAATTTGACTACTTGAGGCTCCAAGAAGCCCTAAGGCTTAGTCTTGAGAGGGAGAACGTTCTTCAACTCGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808779.1
MAKRFEEHQIKALRSAFEASDRLTKSRKNELAEATGLDVEQVSSWFSRERAGKKARESVFLLEFDYLRLQEALRLSLERENVLQLEIEECKKKAVEIEAENQRLRESCKRAVEFDEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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