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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001804`

染色体: Chr04 坐标: 29526881-29529868 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001804`
名称	SmilChr04G001804
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29526881 - 29529868 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019676`
GeneID	`131019676`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019676`
原始查询	`SmilChr04G001804`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=26.9; qcov=1.03; evalue=8.67e-70; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=29.5; qcov=1.02; evalue=1.06e-78; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019676

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057804250.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057804250.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057804250.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804250.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804250.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29526994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B41,C30,C49
`Chr4:29527048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr4:29527307`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B100,B82,C16,C85
`Chr4:29527307`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B100,B82,C16,C85
`Chr4:29527368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:29527386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D7
`Chr4:29527417`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	56	A10,A11,B101,B102,B111,B112,B114,B115,B125,B136,B14,B140,B15,B21,B24,B28,B31,B34,B35,B36,B40,B47,B49,B58,B60,B63,B66,B68,B7,B85,B87,B88,B90,B92,B93,B94,C11,C33,C44,C48,C52,C55,C6,C61,C62,C68,C69,C7,C76,C86,C87,D1,D10,D3,D6,D9
`Chr4:29527428`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	54	A10,A11,B102,B111,B112,B114,B115,B125,B136,B14,B140,B15,B21,B24,B28,B31,B34,B35,B36,B40,B47,B49,B58,B60,B63,B66,B68,B7,B85,B87,B88,B90,B92,B93,B94,C11,C33,C44,C48,C52,C55,C6,C61,C62,C68,C69,C7,C76,C86,C87,D10,D3,D6,D9
`Chr4:29527437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	53	A10,A11,B102,B111,B112,B114,B115,B125,B14,B140,B15,B21,B24,B28,B31,B34,B35,B36,B40,B47,B49,B58,B60,B63,B66,B68,B7,B85,B87,B88,B90,B92,B93,B94,C11,C33,C44,C48,C52,C55,C6,C61,C62,C68,C69,C7,C76,C86,C87,D10,D3,D6,D9
`Chr4:29527457`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	64	A14,A18,A3,A6,A7,A9,B10,B100,B103,B107,B109,B11,B12,B121,B131,B132,B134,B138,B19,B28,B34,B37,B4,B40,B41,B45,B5,B55,B60,B61,B7,B72,B73,B80,B83,B87,B94,B97,B98,C12,C15,C2,C20,C24,C26,C28,C3,C38,C40,C5,C51,C56,C61,C64,C66,C72,C73,C77,C78,C81,D1,D2,D8,D9
`Chr4:29527505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C2,C45
`Chr4:29527511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C30,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804250.1

861 aa

430

861

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 159-319 aa PF23559 WHD_DRP 403-474 aa PF23598 LRR_14 521-752 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804250.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	159	319	4.6e-34	118.2	NB-ARC domain
`XP_057804250.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	403	474	4e-20	72.3	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057804250.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	521	752	4.5e-20	72.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948267.1
ATTCGAGAGATATCGTTGGTTGAAGTATCAATATTATTTCTTCACTGTTGTAGAGAGAGAGAAAGCAGAGCAGAAATGGCTTACTATGCACTCATCGTTTCTCTGAAGCAGACCTTAGAGCCCCTGCTTGATTCCGTTGCATCCAAAATTCAAATTCCCAACTCAGAGCTAAAACTAATTTACGACGACCTTTGCTACCTAAAATCCTTTTTCAATAAAATAATTTCTTTGGAACACAGCAATAGCGTGGAGGAGCTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019676
ATGGCTTACTATGCACTCATCGTTTCTCTGAAGCAGACCTTAGAGCCCCTGCTTGATTCCGTTGCATCCAAAATTCAAATTCCCAACTCAGAGCTAAAACTAATTTACGACGACCTTTGCTACCTAAAATCCTTTTTCAATAAAATAATTTCTTTGGAACACAGCAATAGCGTGGAGGAGCTGGAAAAGCAAATCAAGGATGTAGTGCAGAAGGCTCAAGATCTGATTGAATCCCATCTATCAGATCTAGTTCACCCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804250.1
MAYYALIVSLKQTLEPLLDSVASKIQIPNSELKLIYDDLCYLKSFFNKIISLEHSNSVEELEKQIKDVVQKAQDLIESHLSDLVHPGDESSVSGFSHELGEVKDRLGSLIEMVKAKEDWLTGNQQSADPLAADVAVSSEIDFGRNNIIVGLENETMHLKVWVFGMPSSLQVICIVGMAGIGKTALAKQVYLHQLINEHFTTLLFLEIGIAYELKDLLLRLLGQLVSEHMEEATVDELGYQLHKCLYGGRYLVVLDDIWDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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