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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001809`

染色体: Chr04 坐标: 29569743-29573457 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001809`
名称	SmilChr04G001809
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29569743 - 29573457 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019681`
GeneID	`131019681`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019681`
原始查询	`SmilChr04G001809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=29.6; qcov=0.912; evalue=1.65e-71; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30.8; qcov=0.971; evalue=1.8e-76; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13401 (AAA_22); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019681

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804252.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804252.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804252.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804252.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804252.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29570733`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A1,A2,A6,B110,B127,B139,B32,B37,B51,B6,B62,B9,B91,C18,C25,C27,C36,C43,C65,C66,C80,D2,D5
`Chr4:29570735`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A1,A2,A6,B110,B127,B139,B32,B37,B51,B6,B62,B9,B91,C18,C25,C27,C36,C43,C65,C66,C80,D2,D5
`Chr4:29570748`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C57
`Chr4:29570748`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C57
`Chr4:29570794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:29570813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B18,C9
`Chr4:29570908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B47
`Chr4:29570960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:29571059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C10,C7
`Chr4:29571092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C13
`Chr4:29571169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B53,C37
`Chr4:29571183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B82,C16,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804252.1

696 aa

348

696

Rx_N

NB-ARC

AAA_22

WHD_DRP

PF18052 Rx_N 5-85 aa PF00931 NB-ARC 162-327 aa PF13401 AAA_22 179-266 aa PF23559 WHD_DRP 421-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804252.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	85	3.4e-16	59.9	Rx N-terminal domain
`XP_057804252.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	162	327	7.1e-44	150.1	NB-ARC domain
`XP_057804252.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	179	266	2.9e-07	31.6	AAA domain
`XP_057804252.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	421	487	1e-18	67.8	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100373.1
ACTCGTGAATTGTGATCTAAATATTCGTGGCCCCACATTCCCTCGTCAAACTCCAGAAAAGAAAAAATGAAAAAAAAATGCGTGATTCACTTTTTGTTGTGGAAAGTTGAAGTTGATAAAACAATAATGCCGGCGAACAGTTGAGCATGAGTTTGTGAGTCAACCCAGTACCAAATTCCGGCGATCCCGGATCGGATCGGAGTTGGAAAATGGCGGACGCTGCAGTTACGTTCCTCCTGGAAAACGTGGCCCAGCTGGTG...

XR_009100374.1
GAAAAGAAAAAATGAAAAAAAAATGCGTGATTCACTTTTTGTTGTGGAAAGTTGAAGTTGATAAAACAATAATGCCGGCGAACAGTTGAGCATGAGTTTGTGAGTCAACCCAGTACCAAATTCCGGCGATCCCGGATCGGATCGGAGTTGGAAAATGGCGGACGCTGCAGTTACGTTCCTCCTGGAAAACGTGGCCCAGCTGGTGAGGCACCGATTCAATCTCATCGCCGGCGCGGAAGGTGAACTGGAGCTGTTAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019681
ATGGCGGACGCTGCAGTTACGTTCCTCCTGGAAAACGTGGCCCAGCTGGTGAGGCACCGATTCAATCTCATCGCCGGCGCGGAAGGTGAACTGGAGCTGTTAAAGAAGGATCTGGAGTCGTTGAAGGCCTTCCTCCGCCACGCGGCCAGGATGCCGGACAAGCCCGAAGGATTCCGAGATATAGAGGGGCGGATCAGAGATGTCGTGTATGAAGCTGAAGACAACATCGACTCTTGCACCTCCCACGCTACAGCAGCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804252.1
MADAAVTFLLENVAQLVRHRFNLIAGAEGELELLKKDLESLKAFLRHAARMPDKPEGFRDIEGRIRDVVYEAEDNIDSCTSHATAAINKNAIRRRLSSKRVNLAEQVKLLRQGKVIQMVATAQSFAATAMGKEPQATKHGSPSKPAKLQIIREENVVGFDDKEGKIISYLLEPKQELDVISITGMPGLGKTTLAWKVFKNEHIIKREFPNRIWIYVTQTPNIRDVFLNILKEFTSEDMSGLSDRALIETVQQYLKERKFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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