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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001812`

染色体: Chr04 坐标: 29611303-29612169 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001812`
名称	SmilChr04G001812
描述	uncharacterized SmilChr04G001812
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29611303 - 29612169 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023259`
GeneID	`131023259`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023259`
原始查询	`SmilChr04G001812`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0909400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0909400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G12690` (AT4G12690) DUF868 family protein (DUF868) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826881] identity=46.9; qcov=0.948; evalue=4.68e-83; confidence=high
Rice	`Os01g0909400` - identity=49.5; qcov=1.13; evalue=1.4e-104; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05910 (DUF868)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023259

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808785.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808785.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808785.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808785.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808785.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29611663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr4:29611741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B52,B53,C37,D11,D7
`Chr4:29611794`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A14,A5,B132,B133,B20,B32,B62,B63,B64,B90,C2,C24,C55,C57,C69,C71,C73,C83,C86
`Chr4:29611806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B58,C69,C83
`Chr4:29611831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B62,B90,C69
`Chr4:29611912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:29611922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B105,B110,B32,B6,C63,C64,C73,C8,C84,D5
`Chr4:29611966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B131,B22
`Chr4:29612115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808785.1

288 aa

144

288

DUF868

PF05910 DUF868 24-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808785.1`	Pfam	`PF05910`	DUF868	Family	24	286	1.6e-104	350.1	Plant protein of unknown function (DUF868)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952802.1
ATGCAGGAGCAAATCGGCATTCCAGCTTGCTTCTCTGCGGGGGAGAACGATTCCGCAACGATCACAAGATCAGGGCAGAATGTTTTCATGTCAGTTTACCGCACCAAATTAGCGGATCAATGCCGTCTGATCACAGTCACATGGTGCAAGAATCTGCTGCTTCACGGCCTCTCCATCTCCGTCGACGGCGGCGGCGACAGAGACACCCAATCCACCTGCAAAATCGAGCTCAAGCCATGGTATTTCTGGCGGAAGCACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023259
ATGCAGGAGCAAATCGGCATTCCAGCTTGCTTCTCTGCGGGGGAGAACGATTCCGCAACGATCACAAGATCAGGGCAGAATGTTTTCATGTCAGTTTACCGCACCAAATTAGCGGATCAATGCCGTCTGATCACAGTCACATGGTGCAAGAATCTGCTGCTTCACGGCCTCTCCATCTCCGTCGACGGCGGCGGCGACAGAGACACCCAATCCACCTGCAAAATCGAGCTCAAGCCATGGTATTTCTGGCGGAAGCACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808785.1
MQEQIGIPACFSAGENDSATITRSGQNVFMSVYRTKLADQCRLITVTWCKNLLLHGLSISVDGGGDRDTQSTCKIELKPWYFWRKHGSKRFAVEGKAVDVFWDLKIARFNGETEPISDYYVAVVFDGEVVLLLGNLRKEAFRKTGCRPSLIDPILISRKEHIFGKRKFTTRLKFHDKGSLHEISIECKNRGGGGGVEPEMEIRIDGHLVIHVKHLQWKFRGNELIHLNKAKIEVYWDVHDWLFSPGLRHALFIFKPTLLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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