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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001813`

染色体: Chr04 坐标: 29633382-29634236 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001813`
名称	SmilChr04G001813
描述	uncharacterized SmilChr04G001813
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29633382 - 29634236 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023260`
GeneID	`131023260`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023260`
原始查询	`SmilChr04G001813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=28.3; qcov=0.648; evalue=3.53e-16; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=27.4; qcov=0.655; evalue=3.39e-24; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023260

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057808786.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057808786.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808786.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808786.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808786.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29633431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:29633448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B28,C57
`Chr4:29633455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr4:29633481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr4:29633524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,B72,C36
`Chr4:29633569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B82,C27,C63
`Chr4:29633571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,C30,C57
`Chr4:29633606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr4:29633607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr4:29633613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A10,B106,B109,B27,B38,B39,B55,B98,C13,C85,D5
`Chr4:29633626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:29633636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808786.1

284 aa

142

284

DUF4283

PF14111 DUF4283 37-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808786.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	37	111	1.6e-08	34.9	Domain of unknown function (DUF4283)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952803.1
ATGGATCCAGAGGAAATAGTGAAGAGGGTCGCGGAGTTAAAACTCTCGTCTGAAGCGAAAGACAAGCGGGTTACACTCACCGCTTCCGATGCAGTAGACGGTAAATCAAGGGCAAGGAAAATCATTTTGGGCAAAATCTTCTCAGAAAGGTTGGTGAATCGAGAGGCCCTGCGAGAAAACCTCCCCTCTGTTTTCCGACCCAGAGGCACCATGGAGAAAGAACTGGTGGGTCGAAATATCTTTGCTGCAACCTTCGATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023260
ATGGATCCAGAGGAAATAGTGAAGAGGGTCGCGGAGTTAAAACTCTCGTCTGAAGCGAAAGACAAGCGGGTTACACTCACCGCTTCCGATGCAGTAGACGGTAAATCAAGGGCAAGGAAAATCATTTTGGGCAAAATCTTCTCAGAAAGGTTGGTGAATCGAGAGGCCCTGCGAGAAAACCTCCCCTCTGTTTTCCGACCCAGAGGCACCATGGAGAAAGAACTGGTGGGTCGAAATATCTTTGCTGCAACCTTCGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808786.1
MDPEEIVKRVAELKLSSEAKDKRVTLTASDAVDGKSRARKIILGKIFSERLVNREALRENLPSVFRPRGTMEKELVGRNIFAATFDLESDREHILTEGPWHYFNELMILQETDTKSTAANAEFDKITLWVQLHNMPITCMEASVVRRIGEQIGRVIEVDCGAGGMCLGRYARVKISRSIHEPLTRCVPLVVEGEEEDNLILVLYERLPDQFCYACGKLGHYLKSCSLGEKEKKKAKFGPWLRAGCGVDYRKQANPKPQAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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