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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001814`

染色体: Chr04 坐标: 29639373-29642256 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001814`
名称	SmilChr04G001814
描述	50S ribosomal protein L19-1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29639373 - 29642256 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019686`
GeneID	`131019686`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019686`
原始查询	`SmilChr04G001814`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L19-1, chloroplastic-like
产物	50S ribosomal protein L19-1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G11630` (AT4G11630) Ribosomal protein L19 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826768] identity=71.7; qcov=0.626; evalue=3.02e-75; confidence=high
Rice	`Os02g0205000` - identity=57.4; qcov=0.802; evalue=1.47e-68; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01245 (Ribosomal_L19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019686

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057804260.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057804260.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804260.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804260.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804260.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29639683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr4:29639797`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B108
`Chr4:29639797`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B108
`Chr4:29639802`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B108
`Chr4:29639802`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B108
`Chr4:29640860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A22,B126,B19,B86
`Chr4:29640879`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A22,B126,B19,B86
`Chr4:29640879`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A22,B126,B19,B86
`Chr4:29640882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C47
`Chr4:29641052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B69
`Chr4:29641112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C83
`Chr4:29641125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804260.1

243 aa

122

243

Ribosomal_L19

PF01245 Ribosomal_L19 141-237 aa

XP_057804261.1

243 aa

122

243

Ribosomal_L19

PF01245 Ribosomal_L19 141-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804260.1`	Pfam	`PF01245`	Ribosomal_L19	Family	141	237	1.9e-29	102.6	Ribosomal protein L19
`XP_057804261.1`	Pfam	`PF01245`	Ribosomal_L19	Family	141	237	1.9e-29	102.6	Ribosomal protein L19

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948277.1
GGAAAATAATAAAATCTCTCGGACTATAAAAAGTAAAAACCTCATGGTCATGGGTAGTTTAGAAAGTAGGGAAAACCTCAAGGGCCATTATGTTAAATCTCGATTCTGAAATCAAAAACCTTCACTCGCTGCCTAACTAGGGTTTTGCATTCAGCTCTTGAATCCATCCCCATTCCACAGGTTTTTGATCGGAGGATTCGAAATGCAATCGCTATATGGTAAATTCCGGCTGGTCACGAAACAAACAATCAACTCGCTGA...

XM_057948278.1
TGATATTTCCCCCCATTTCTTGTATCTATCATTGTTACTAAGTGCAAAATAGACCCTAATTTCCCCCCTGTTCCTCATTAACTCCAGGTTTTTGATCGGAGGATTCGAAATGCAATCGCTATATGGTAAATTCCGGCTGGTCACGAAACAAACAATCAACTCGCTGAAAAATATTGAGCTGAGCAAAGTCGCATCTGTTGAATCGAGATATTTGGGATGCTCGATGAACCGGTTTTCGGGTTTCAGTTCTGAGCGTTCAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019686
ATGCAATCGCTATATGGTAAATTCCGGCTGGTCACGAAACAAACAATCAACTCGCTGAAAAATATTGAGCTGAGCAAAGTCGCATCTGTTGAATCGAGATATTTGGGATGCTCGATGAACCGGTTTTCGGGTTTCAGTTCTGAGCGTTCAGCATTTCTTTTGAATAAACAATTTGGCGCTAAAGTTGTCAAACCAGCATCCTCTGAAAGTTGTAGTATGGCATCAATGTTGCCATCTTACAGAGTCCTAAGCTCTGGAAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804260.1
MQSLYGKFRLVTKQTINSLKNIELSKVASVESRYLGCSMNRFSGFSSERSAFLLNKQFGAKVVKPASSESCSMASMLPSYRVLSSGSQSASLVFKFPTRNFSTPGSTPENVSASSELPPRIKFKRLDKTARHIMQIIDKEAVEEVKSSREIPEIKPGYIIQLKVVVPENKRRVSIIKGIVIAMRNAGLNTTFRIRRLVGGVGIENLFPLYSPNIKEITVLDKKRVRRAKLYYLRDRMNPLRKN

XP_057804261.1
MQSLYGKFRLVTKQTINSLKNIELSKVASVESRYLGCSMNRFSGFSSERSAFLLNKQFGAKVVKPASSESCSMASMLPSYRVLSSGSQSASLVFKFPTRNFSTPGSTPENVSASSELPPRIKFKRLDKTARHIMQIIDKEAVEEVKSSREIPEIKPGYIIQLKVVVPENKRRVSIIKGIVIAMRNAGLNTTFRIRRLVGGVGIENLFPLYSPNIKEITVLDKKRVRRAKLYYLRDRMNPLRKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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