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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001839`

染色体: Chr04 坐标: 29928479-29929915 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001839`
名称	SmilChr04G001839
描述	U-box domain-containing protein 52-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29928479 - 29929915 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019708`
GeneID	`131019708`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019708`
原始查询	`SmilChr04G001839`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 52-like
产物	U-box domain-containing protein 52-like
Arabidopsis	`AT5G47740` (AT5G47740) Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834825] identity=35.9; qcov=0.926; evalue=6.1e-35; confidence=medium
Rice	`Os10g0100500` (OsPUB61) - identity=27.9; qcov=0.69; evalue=2.73e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00582 (Usp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019708

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804281.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057804281.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804281.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804281.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804281.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29929561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B88,C7,C76,D1
`Chr4:29929818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804281.1

229 aa

114

229

Usp

PF00582 Usp 43-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804281.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	43	158	1.3e-05	26.5	Universal stress protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948298.1
ATCACTCACACACACACGACACAGGTTGTGAGTTGTGACATGAAAAAAGTTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATCAAACCCTTTTTTATTTTGTGATTTTCTTTACTCCTTCATGGCTTTGAAAGCAACGACCCTTTTCTTACAACCTCATCACTCATACTTGTTGTTTTCCTCTTTTGTGTGAATTCGAGTGATACATATGGAGGAGGGGCAGTATCGTAATTTGGCAGCAAAGTCGTCGCCGGAGATAGTAGAGATTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019708
ATGGAGGAGGGGCAGTATCGTAATTTGGCAGCAAAGTCGTCGCCGGAGATAGTAGAGATTGCGGAGGAGAGTAATAGCACAGCCGCCAGCAGAGATGGTGGTGATGTATATGTTGCTGTTGGTAAGCACGATTTGCACGTGCTCAGATGGGCTCTCGATCATGTCGTCTCGCCAGAGAGTCGTGTTTTTCTCGTCCACGTTTTCTCTCCGATCACCTACGTCCCCACGCCAGTTGGGAGGCTATCAAGAAGCCAGCTTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804281.1
MEEGQYRNLAAKSSPEIVEIAEESNSTAASRDGGDVYVAVGKHDLHVLRWALDHVVSPESRVFLVHVFSPITYVPTPVGRLSRSQLSKDQLQVYIREESNKRKHLLDKYIQLCNDSKISVDTMLVESNASGKAILELIGVANITHLVMGTKQSPFSRLSRKGVGKGEYVKKYAPEYCEVSVVYDDAKKMKDEQPQIRDDSKNASHQTQQVTKNSQRHFFECVCFSGKFD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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