当前解析结果
SmilChr04G001847| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001847 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001847 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001847 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 30134126 - 30134509 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023268 |
|---|---|
| GeneID | 131023268 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023268 |
| 原始查询 | SmilChr04G001847 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023268 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057808796.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057808796.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057808796.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808796.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808796.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:30134152 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B38 |
Chr4:30134154 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B4,B97,C30,C36,C49 |
Chr4:30134161 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,C32 |
Chr4:30134171 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B56 |
Chr4:30134177 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,B38 |
Chr4:30134192 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C66 |
Chr4:30134197 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr4:30134240 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A5,B135,B48 |
Chr4:30134241 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B109,B18,B3,B78,B79 |
Chr4:30134250 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr4:30134253 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B51 |
Chr4:30134254 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C32,C33 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。