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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001849`

染色体: Chr04 坐标: 30152461-30154423 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001849`
名称	SmilChr04G001849
描述	transcription factor MYB86-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	30152461 - 30154423 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019712`
GeneID	`131019712`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019712`
原始查询	`SmilChr04G001849`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB86-like
产物	transcription factor MYB86-like
Arabidopsis	`AT5G26660` (MYB86) myb domain protein 86 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832723] identity=72.4; qcov=0.464; evalue=1.96e-79; confidence=medium
Rice	`Os05g0140100` (OsMYB2P-1) - identity=61.2; qcov=0.622; evalue=4.61e-79; confidence=high
GO	GO:0010119 (regulation of stomatal movement)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019712

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804286.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804286.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804286.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804286.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804286.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:30152724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C13,C4
`Chr4:30152773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr4:30152973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr4:30153621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C30,C49
`Chr4:30154057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D7
`Chr4:30154095`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A10,A20,A24,B101,B117,B126,B130,B24,B34,B46,B59,B85,B87,C17,C4,C42,C44,C54,C7,C73,C76,D1,D6
`Chr4:30154098`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A10,A20,A24,B101,B117,B126,B130,B24,B34,B46,B59,B85,B87,C17,C4,C42,C44,C54,C7,C73,C76,D1,D6
`Chr4:30154119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B140
`Chr4:30154126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804286.1

336 aa

168

336

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-75 aa PF00249 Myb_DNA-binding 67-110 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 70-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804286.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	9.4e-35	119.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057804286.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	75	2.6e-20	73.1	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057804286.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	67	110	9.4e-35	119.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057804286.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	70	116	2.6e-20	73.1	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948303.1
AAAAGCAGCACCAGAATTTGCTTAGAAACCACTTGATTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATATGACTTGAATCTTAAGTATGATTTTATTTTTCTGTTAAGCCCCTTTAAATGATCACAACATTTTCCCAATGATATAGTTCACTCAGACATGTTTGTTCAGCCATGTTAGAGACAGACGTAAACTAACCATATATAGCTGTCGCTATTAAGTCTCGATCTCCAGAAGAGTTGCTTCAATTCGATCGACCTCTGAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019712
ATGGGCCGCAATTCCTGCTGTGTGAAGCAGAAGCTCAGGAAAGGGCTGTGGTCGCCCGAAGAGGATGAGAAGCTCTACAATTACATCACCAGATTCGGCGTCGGCTGCTGGAGCTCAGTGCCTAAATTAGCAGGATTGCAAAGATGTGGAAAAAGCTGCAGATTGAGATGGATTAACTACTTGAGGCCTGATCTCAAAAGAGGCATGTTTTCACAACAAGAGGAAGATCTTATCCTTAATCTCCACCAAGCTTTAGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804286.1
MGRNSCCVKQKLRKGLWSPEEDEKLYNYITRFGVGCWSSVPKLAGLQRCGKSCRLRWINYLRPDLKRGMFSQQEEDLILNLHQALGNRWAQIAAQLPGRTDNEIKNFWNSSLKKKLLKQGVDPNTHKPMMSIKDERESSSVDLRSSSSLQINNHGLQTSGSETYNLSSLLCNSNAAGPKMRENFSNKQVYDPLFLSEFQANVDPDGFQSNFLSHSNHNNPININPICGFNSMPDLTNFDIHHHNLAKLGINEAKESPILN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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