当前解析结果
SmilChr04G001851| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001851 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001851 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001851 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 30175640 - 30177631 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023269 |
|---|---|
| GeneID | 131023269 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023269 |
| 原始查询 | SmilChr04G001851 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023269 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808798.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057808798.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808798.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808798.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808798.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:30175855 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B12,B39,B55,C59 |
Chr4:30175864 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B12,B39,B55,C59 |
Chr4:30175895 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B93,C39 |
Chr4:30175926 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 5 | B51,C14,C58,C65,C73 |
Chr4:30175926 |
C |
CT |
1bp_insertion | CDS_variant | 5 | B51,C14,C58,C65,C73 |
Chr4:30175937 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B113,B45,C63,C67 |
Chr4:30175951 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr4:30175957 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B114 |
Chr4:30175957 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr4:30175977 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B59,C49,C53,C55,D4 |
Chr4:30175983 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B63 |
Chr4:30175984 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 111 | A18,A19,A2,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A7,B1,B101,B103,B106,B11,B113,B119,B120,B124,B125,B126,B128,B129,B131,B135,B140,B15,B17,B19,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B33,B34,B36,B39,B41,B42,B43,B44,B46,B48,B49,B51,B56,B58,B59,B61,B66,B67,B68,B71,B74,B80,B84,B87,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,C11,C12,C15,C16,C17,C18,C2,C26,C27,C29,C3,C30,C34,C36,C38,C4,C40,C44,C45,C46,C48,C52,C58,C59,C60,C68,C69,C7,C76,C80,C81,C83,C84,C86,C9,D4,D8,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。