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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001856`

染色体: Chr04 坐标: 30227113-30228504 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001856`
名称	SmilChr04G001856
描述	uncharacterized SmilChr04G001856
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	30227113 - 30228504 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023271`
GeneID	`131023271`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023271`
原始查询	`SmilChr04G001856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968]; symbol=AT1G43760; hit=AT1G43760; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968]; symbol=AT1G43760; hit=AT1G43760; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=26; qcov=0.814; evalue=2.09e-33; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=27; qcov=0.76; evalue=4.02e-33; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023271

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808800.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808800.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808800.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808800.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808800.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:30227302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr4:30227402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr4:30227495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr4:30227497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B129,C29,C5,C81
`Chr4:30227528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:30227558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:30227583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:30227664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C10,C7,C79
`Chr4:30227749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,B85,C69,C80,C83
`Chr4:30227776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C20,C63,C68
`Chr4:30227833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:30227882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,A3,B128

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808800.1

463 aa

232

463

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 5-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808800.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	5	220	6.1e-06	26.9	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952817.1
ATGAATATGCTCGTTTGGAACGTCCGTGGTCTTACGGACGAGTCTAAGCGTTTGATGAAGGAGTATTGTCATTCTTTTGCTCCTATAGTGCTGGGTATTATTGAGCCGAAATCTAAATTTCAGAAAGTCCAGCAGAATTTTTGGTTATCTTTGAATATGGTTCCTTGTCACCAAAATTGCAGGCTTCCTCGTCGTTCTAATATTTGGTTTCTAGCGCACCCTTCGGTCCAGACTAGCGTTGTCTTATCTTCTTCTCAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023271
ATGAATATGCTCGTTTGGAACGTCCGTGGTCTTACGGACGAGTCTAAGCGTTTGATGAAGGAGTATTGTCATTCTTTTGCTCCTATAGTGCTGGGTATTATTGAGCCGAAATCTAAATTTCAGAAAGTCCAGCAGAATTTTTGGTTATCTTTGAATATGGTTCCTTGTCACCAAAATTGCAGGCTTCCTCGTCGTTCTAATATTTGGTTTCTAGCGCACCCTTCGGTCCAGACTAGCGTTGTCTTATCTTCTTCTCAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808800.1
MNMLVWNVRGLTDESKRLMKEYCHSFAPIVLGIIEPKSKFQKVQQNFWLSLNMVPCHQNCRLPRRSNIWFLAHPSVQTSVVLSSSQAVVVDCYWQNRNFRVAVVHCSNDAGERRFLWADLISVITRNTVFIGDFNAVKGANERISSVSPSRRACQDFCDFIENSGFGEPTTSGLHFTWSGRRFLPRHVESVLDRALISDGFADMWDSINSHALPRISSDHSPLILQCKLAMPTGKRHFKFLNMWVLHPEFQNMVAASWND...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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