当前解析结果
SmilChr04G001867| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001867 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001867 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001867 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 30460860 - 30462507 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023273 |
|---|---|
| GeneID | 131023273 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023273 |
| 原始查询 | SmilChr04G001867 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023273 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808803.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057808803.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057808803.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.20000 | XP_057808803.1 |
| 5 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057808803.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:30461982 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C81,C87 |
Chr4:30462002 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C81,C87 |
Chr4:30462036 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A1 |
Chr4:30462037 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C43,C81,C87 |
Chr4:30462058 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr4:30462094 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr4:30462102 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C81,C87 |
Chr4:30462108 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr4:30462113 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C81,C87 |
Chr4:30462147 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C15,C86 |
Chr4:30462156 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 60 | A15,A20,A6,A8,B10,B100,B106,B11,B123,B133,B136,B137,B17,B18,B19,B25,B26,B32,B33,B34,B36,B41,B47,B50,B51,B52,B57,B60,B63,B72,B73,B77,B79,B81,B83,B86,B87,B88,B9,B93,C10,C18,C2,C26,C28,C3,C35,C36,C39,C40,C41,C5,C51,C6,C71,C75,C77,C82,C87,D11 |
Chr4:30462162 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 34 | A20,A6,A8,B10,B106,B137,B18,B19,B25,B32,B33,B34,B41,B50,B52,B60,B63,B72,B73,B79,B81,B83,B86,B9,C10,C26,C28,C35,C36,C41,C6,C75,C82,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。