当前解析结果
SmilChr04G001879| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001879 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001879 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001879 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 30698489 - 30698977 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023275 |
|---|---|
| GeneID | 131023275 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023275 |
| 原始查询 | SmilChr04G001879 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023275 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.80000 | XP_057808805.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057808805.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808805.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808805.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808805.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:30698519 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B106 |
Chr4:30698529 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B50,C67 |
Chr4:30698537 |
CAG |
* |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | B11,B3,C15,C31,C42 |
Chr4:30698554 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B33,B61 |
Chr4:30698599 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B117,B70,B71,C69 |
Chr4:30698629 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr4:30698637 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B53,B81,C6,C82 |
Chr4:30698640 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | B20,B3,B38,B69,C1,C16,C3,C56 |
Chr4:30698646 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B117 |
Chr4:30698646 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B117 |
Chr4:30698648 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B117 |
Chr4:30698648 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B117 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。