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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001899`

染色体: Chr04 坐标: 31035479-31039870 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001899`
名称	SmilChr04G001899
描述	arginine-specific demethylase JMJ20
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31035479 - 31039870 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019888`
GeneID	`131019888`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019888`
原始查询	`SmilChr04G001899`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	arginine-specific demethylase JMJ20
产物	arginine-specific demethylase JMJ20
Arabidopsis	`AT5G63080` (AT5G63080) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836428] identity=56.1; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0546900` (JMJ709) - identity=56.8; qcov=0.751; evalue=3.54e-138; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0010629 (negative regulation of gene expression); GO:0018126 (protein hydroxylation); GO:0033749 (histone H4R3 demethylase activity); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0043985 (GO:0043985); GO:0045905 (positive regulation of translational termination)
KEGG	-
Pfam	PF02373 (JmjC); PF13621 (Cupin_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019888

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804465.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804465.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057804465.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804465.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804465.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31036075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:31036227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C11,C69
`Chr4:31037464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:31038601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B14,B44
`Chr4:31039706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804465.1

469 aa

234

469

Cupin_8

JmjC

PF13621 Cupin_8 20-278 aa PF02373 JmjC 171-276 aa

XP_057804466.1

469 aa

234

469

Cupin_8

JmjC

PF13621 Cupin_8 20-278 aa PF02373 JmjC 171-276 aa

XP_057804467.1

469 aa

234

469

Cupin_8

JmjC

PF13621 Cupin_8 20-278 aa PF02373 JmjC 171-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804465.1`	Pfam	`PF13621`	Cupin_8	Domain	20	278	1.4e-22	81.5	Cupin-like domain
`XP_057804465.1`	Pfam	`PF02373`	JmjC	Domain	171	276	2.8e-17	63.9	JmjC domain, hydroxylase
`XP_057804466.1`	Pfam	`PF13621`	Cupin_8	Domain	20	278	1.4e-22	81.5	Cupin-like domain
`XP_057804466.1`	Pfam	`PF02373`	JmjC	Domain	171	276	2.8e-17	63.9	JmjC domain, hydroxylase
`XP_057804467.1`	Pfam	`PF13621`	Cupin_8	Domain	20	278	1.4e-22	81.5	Cupin-like domain
`XP_057804467.1`	Pfam	`PF02373`	JmjC	Domain	171	276	2.8e-17	63.9	JmjC domain, hydroxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948483.1
CCAGGGCCAGCCCTGCTCATTGAAAGTGAAGCTATGAGAATTTTGAGGCCCTGTCATGGATTAAGGATAAAGGTTTGGAATGGGTAGATGATGGTTGACGATGCGATCTTCTTGAGTGTTCAAGATGATGGTGAGTTCGGTGGCATAATTGTTAATCGTCCGCTTCTCCTTGCAGATTTTGATAATATTCGAGATTGTTACGTGCAACCAAGAGTCGCAGGAGGAAGAGAGAGAGAGGAGCGACGATGGGTCTCAAAATC...

XM_057948482.1
CAGGGCCAGCCCTGCTCATTGAAAGTGAAGCTATGAGAATTTTGAGGCCCTGTCATGGATTAAGGATAAAGGTTTGGAATGGGTAGATGATGGTTGACGATGCGATCTTCTTGAGTGTTCAAGATGATGGTGAGTTCGGTGGCATAATTGTTAATCGTCCGCTTCTCCTTGCAGATTTTGATAATATTCGAGATTGTTACGTGCAACAAAAAAAAGGAATGCAAAACTGGTGGGACCAAGAAACTGAGTGTTTTTTCGAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131019888
ATGGGTCTCAAAATCGAAGGAAAAGTGGAGAAGGTAAACGGGAAGGAACTGTCCTACGCCGAGTTTGTCGAAAAATATCTCGATAAAAACCAGCCGGTAATCCTAACCGGGCTCACGGACGATTGGCGAGCACGCAAGGACTGGGTTTCCGGTGACGGAAAGCCTAATCTCCGCTTCTTCTCCGACCAATTCGGCGGCTCCAGAGTCCAGGTTGCGGATTGTGCTAAGAGGGAATTCACTGATCAAAAGAGGTTGGAAAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804465.1
MGLKIEGKVEKVNGKELSYAEFVEKYLDKNQPVILTGLTDDWRARKDWVSGDGKPNLRFFSDQFGGSRVQVADCAKREFTDQKRLEMSVSEFIEIWINSSNSDNGGADGKPLLYLKDWHFVKEYPDYVAYSTPVFFRDDWLNLYLDEYHMHDDPETYRERNEVNCSDYRFVYMGAKGTWTPLHADVFRSYSWSANVCGRKQWYFLCPSQHHLVFDRYMKSAVYNIFEDVCKSKYPGFEEAVWLECTQERDEIIFVPSGWY...

XP_057804466.1
MGLKIEGKVEKVNGKELSYAEFVEKYLDKNQPVILTGLTDDWRARKDWVSGDGKPNLRFFSDQFGGSRVQVADCAKREFTDQKRLEMSVSEFIEIWINSSNSDNGGADGKPLLYLKDWHFVKEYPDYVAYSTPVFFRDDWLNLYLDEYHMHDDPETYRERNEVNCSDYRFVYMGAKGTWTPLHADVFRSYSWSANVCGRKQWYFLCPSQHHLVFDRYMKSAVYNIFEDVCKSKYPGFEEAVWLECTQERDEIIFVPSGWY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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