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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001900`

染色体: Chr04 坐标: 31042861-31045572 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001900`
名称	SmilChr04G001900
描述	uncharacterized SmilChr04G001900
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31042861 - 31045572 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019889`
GeneID	`131019889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019889`
原始查询	`SmilChr04G001900`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NEP-interacting protein, putative (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835080]; symbol=AT5G50150; hit=AT5G50150; species=arabidopsis; confidence=high
产物	NEP-interacting protein, putative (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835080]; symbol=AT5G50150; hit=AT5G50150; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G50150` (AT5G50150) NEP-interacting protein, putative (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835080] identity=77; qcov=0.916; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0474500` - identity=70.9; qcov=0.93; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03080 (Neprosin); PF14365 (Neprosin_AP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057804468.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057804468.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804468.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804468.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804468.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31043281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:31043320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B22
`Chr4:31043338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:31043356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:31043470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr4:31043667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,C40,C63
`Chr4:31043716`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A16,A24,A3,B16,B22,B23,B27,B41,B42,B46,B47,B48,B53,B60,B66,B73,B77,B79,B84,B89,C12,C14,C31,C32,C33,C35,C40,C46,C63,C69,C71,C76,C8,C82,C9,D4,D7
`Chr4:31043758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C35
`Chr4:31044352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr4:31044480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C11,C69
`Chr4:31044870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C11,C69
`Chr4:31044873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804468.1

417 aa

208

417

Neprosin_AP

Neprosin

PF14365 Neprosin_AP 68-174 aa PF03080 Neprosin 199-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804468.1`	Pfam	`PF14365`	Neprosin_AP	Family	68	174	2.8e-36	125.4	Neprosin activation peptide
`XP_057804468.1`	Pfam	`PF03080`	Neprosin	Family	199	410	1.3e-85	286.8	Neprosin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948485.1
GGAAAGCAAGAAGTGGTTGTTTGCCAATGTGGTAAGTTTTACTGCTAAGTTTTGACACCAACCAAACTTACAGCAACAGATATATCTCAACTTGCCTCCCATAAATTCTGCTCAAAACACACAGTGAAGTGGGATTTAATATATTTAGAGTAGAGATGTCAGCCTATAAAACTTTAAAATATTAAGACCCTATTGACCACAATCTGTTATTTGCCTATTTTAATAACCCTCAAAGACTGAAGGTTCTCCAATTCACAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019889
ATGGCCTCTTCTTCCTGTCCCAAAATCCCAATCATTTTCACCCTTGTTTCTTTCCTCTTGATTTTTCTTCCTGCCACCTCCCATGCTGCCGTGCCACCGAGCTCCGGCCGCCGCAACCAGACTCTCCGGCCGCAGCAGGAGCTCAACAAACTCAAGAGAATAAGGAGCTATCTGAGGAAGATCAACAAGCCTGCTGTCAAGACAATTCAGAGCGTTGATGGAGATAAGATAGATTGTGTCCCATCTCATCTTCAGCCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804468.1
MASSSCPKIPIIFTLVSFLLIFLPATSHAAVPPSSGRRNQTLRPQQELNKLKRIRSYLRKINKPAVKTIQSVDGDKIDCVPSHLQPAFDHPQLKGQKPLEPPERPKGHGSNESISETLQAWLEAGESCPVGTVPIRRTTEEDVLRASSIRRFGRKIKRGVRRDTTSSDHEHAVAFVNGDEYYGAKASINVWAPRVTDQYEFSLSQLWVISGSFGNDLNTIEAGWQVSPELYGDNYPRFFTYWTTDAYQATGCYNLLCSGF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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