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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001902`

染色体: Chr04 坐标: 31099298-31100948 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001902`
名称	SmilChr04G001902
描述	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At2g04850
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31099298 - 31100948 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019891`
GeneID	`131019891`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019891`
原始查询	`SmilChr04G001902`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At2g04850
产物	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At2g04850
Arabidopsis	`AT2G04850` (AT2G04850) Auxin-responsive family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815031] identity=70.4; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0194300` - identity=59; qcov=0.936; evalue=2.75e-159; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03188 (Cytochrom_B561); PF04526 (DUF568)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019891

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804469.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804469.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804469.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804469.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804469.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31099407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr4:31099408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:31099877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:31100026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:31100351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B123,B58,C45
`Chr4:31100381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr4:31100466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr4:31100480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B107,C79,C87
`Chr4:31100495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,D10,D11
`Chr4:31100533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804469.1

404 aa

202

404

DUF568

Cytochrom_B561

PF04526 DUF568 83-196 aa PF03188 Cytochrom_B561 249-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804469.1`	Pfam	`PF04526`	DUF568	Family	83	196	2.7e-19	70.5	Protein of unknown function (DUF568)
`XP_057804469.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	249	339	1.1e-07	32.9	Eukaryotic cytochrome b561

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948486.1
GATTTGATGATGATCTTAGAATAAGTGTGGTGGTTGCATGTGGGAAAACAATGATTATGGTGCGCTAGACAATGCCTTTCTTGAAAGGCAAGAACACTAACAAGCTATAGTGTGTAGCTCATGATTAGTAGTATGGACTAACATTTGATCACAAACACAATCTCAATTAATACTCTTTCTTGTTTGACACACATTTGAAAAAATCTCTCGAATCTTGATCTCTCAGTCCAAGAAGAAGAAGAAGATGATGATGAGTCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019891
ATGATGATGAGTCTGTTGTTGTTGCAAATTTTGGTATCCATGAATCCAATGGGAGTATCCTCATCCCACTGCATCACGGCGACCTCATCTAGAACCTTCGATCGTTGCATGACGCTCCCGACCCAGCAAGCATCGATAGCGTGGACGTATGAGCCCCACAACGCGACCCTCGACCTAGCCTTCTTCGGGAGCTTCATCTCCCCCTCGGGGTGGGTCGGGTGGGGGATCAACCCGACCTCCCCGGAGATGACGGGGACGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804469.1
MMMSLLLLQILVSMNPMGVSSSHCITATSSRTFDRCMTLPTQQASIAWTYEPHNATLDLAFFGSFISPSGWVGWGINPTSPEMTGTRALIAFPDPNSGQLVLLPYILDPTVKFQKSPLLSRPLDLHVLSSSATLYGGRMATIHSGATIQIYATLKLSPNKTKLHFTWNRGLYVQGYSPTIHPTAVNDLSSTTTIDILSGATAKPHSNLRTLKIIHGAINAISWGFLLPLGAVSARYLRHIQAVGPAWFYAHAGVQIAAVF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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