当前解析结果
SmilChr04G001915| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001915 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001915 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001915 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 31238938 - 31242092 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131019908 |
|---|---|
| GeneID | 131019908 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019908 |
| 原始查询 | SmilChr04G001915 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os01g0704200; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os01g0704200; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G63040 (AT5G63040)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836424] identity=61.8; qcov=0.898; evalue=3.08e-106; confidence=high |
| Rice | Os01g0704200- identity=58.6; qcov=0.943; evalue=2.25e-114; confidence=high |
| GO | GO:0009507 (chloroplast) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019908 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057804514.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 1.00000 | XP_057804514.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057804514.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804514.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057804514.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:31239571 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A2,A8 |
Chr4:31240039 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C6 |
Chr4:31240316 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B13,B35 |
Chr4:31240396 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B13,B35 |
Chr4:31240418 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr4:31240514 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A23,B69 |
Chr4:31240547 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B13,B35 |
Chr4:31241306 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C4 |
Chr4:31241466 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B98,C80 |
Chr4:31241526 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C1,C12 |
Chr4:31241802 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr4:31241866 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。