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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001926`

染色体: Chr04 坐标: 31361730-31367584 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001926`
名称	SmilChr04G001926
描述	uncharacterized SmilChr04G001926
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31361730 - 31367584 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019899`
GeneID	`131019899`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019899`
原始查询	`SmilChr04G001926`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823977]; symbol=AT3G48200; hit=AT3G48200; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823977]; symbol=AT3G48200; hit=AT3G48200; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G48200` (AT3G48200) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823977] identity=55; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0594500` - identity=47.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF19078 (Big_12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019899

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057804501.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057804501.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057804501.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804501.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804501.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31362248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr4:31362250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C11,C69
`Chr4:31363276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:31363911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B12,B134,B81,C6
`Chr4:31364148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B69
`Chr4:31364214`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr4:31364214`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr4:31364216`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr4:31364216`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr4:31364266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr4:31364945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B65,B76
`Chr4:31365202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804501.1

1081 aa

540

1081

Big_12

PF19078 Big_12 344-436 aa

XP_057804502.1

902 aa

451

902

Big_12

PF19078 Big_12 165-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804501.1`	Pfam	`PF19078`	Big_12	Domain	344	436	1.1e-10	42.3	Bacterial Ig-like domain
`XP_057804502.1`	Pfam	`PF19078`	Big_12	Domain	165	257	2.5e-09	38.0	Bacterial Ig-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948518.1
TGAAAGGCTCAAAAATAGCTAAGGCCTCATTCAATTTTTTGCCTTTGTTGAATGGGGTCGCTTTCTTGTTCGCAACAATTTCGTCAAAATGCATTGAAAACTTTAACGTCTTTCTCCTTTTTCATCTCATTCATTCATGGCTCAGAATCAGAATTGATGGAACTGTTTCACCCAGTCTTCATTTAATACTACCAGGGTCCAGGGGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATCTTCACTGCATTA...

XM_057948519.1
GACACGGTTAAACCCACAGCGCATCTAACAGGAGCGACGAGCTTTACAAGTGCTTCTCGTGTTTCAGTGAACATATCTTTCAGTGAGCCCTGTGGTGGTGGTTTCATGTGCCCTTCTGTAAATGCCTGCAACGTGACTTCTTGTTTATGGTGCTGGAGAGGTCTTGCCAAATACACTCAACGTTATCGAGCCAAGCATGAAATACTCTCTAGTTGTCAGCGTATCTGAGAGAGTTCGATATGGACGCTTGATCCTGGTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019899
ATGGGGTCAAGGTTTTCTTGGTTCTTGCTTCTGCATTGTTGGGTTTTTCTGATTTTGAGTTTGGGAGTGTGCTGCGATGGTTCTGAGGTGGCTGTGAAATTACTGGAGACTCCTCATGCATTCTCCAACAGAAATTACTCCACTTTCTCTTTCCAAGTTTTGGTGGCTGGCAATGACACCATCTGCTCCGACTGTTCCACCACTTGCAAGCTGGATCATGGCAAGGATTCAGCTTGTGAAGGTGGAAGGATATCGTATTC...

LOC131019899
ATGAAATACTCTCTAGTTGTCAGCGTATCTGAGAGAGTTCGATATGGACGCTTGATCCTGGTAATGGACAAAGATTTCTGTACAGACTCTGCAGGAAACCAATTTACAAGAACAGATAACTCAAGTTTAGTAATACATTTTGATAAACGAAGTGTGCTTGTGAACATGAGAACTCATATACCCGAAAGGCTGCTTCAGATAAGCACTGAAACTAGAACTATATTGGCAACTAACAAGGACAAGTTCTTAAAGATATATCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804501.1
MGSRFSWFLLLHCWVFLILSLGVCCDGSEVAVKLLETPHAFSNRNYSTFSFQVLVAGNDTICSDCSTTCKLDHGKDSACEGGRISYSRLLDGNHSFEVCTKGSRGVACASYNWTIDTVKPTAHLTGATSFTSASRVSVNISFSEPCGGGFMCPSVNACNLLVYGAGEVLPNTLNVIEPSMKYSLVVSVSERVRYGRLILVMDKDFCTDSAGNQFTRTDNSSLVIHFDKRSVLVNMRTHIPERLLQISTETRTILATNKDK...

XP_057804502.1
MKYSLVVSVSERVRYGRLILVMDKDFCTDSAGNQFTRTDNSSLVIHFDKRSVLVNMRTHIPERLLQISTETRTILATNKDKFLKIYLYFTEPVMNSSAEILNSIDINQGSLVPINGSSHGQRRFGYQITNISNMAIFTVSLQSNLVITRQGTPVAPVSPVTFLYDSQRPTVRLSTTCDMRTKEKSILVMIKFMKPVFGFNSSHVSVSGGYLQSFQEVSRRSYTAHIRAETDAISIYVPENVTSDVSGNGNGASNTLQVRH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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