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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001930`

染色体: Chr04 坐标: 31404416-31407380 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001930`
名称	SmilChr04G001930
描述	uncharacterized SmilChr04G001930
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31404416 - 31407380 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023286`
GeneID	`131023286`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023286`
原始查询	`SmilChr04G001930`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0539700` - identity=39.5; qcov=0.328; evalue=2.87e-70; confidence=low
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF14214 (Helitron_like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023286

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808815.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808815.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808815.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808815.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808815.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31404442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B14,B44
`Chr4:31404502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A14
`Chr4:31404502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr4:31404515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr4:31404528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,C62,C66,D7
`Chr4:31404545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A5,B126,B58,C62
`Chr4:31404557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A21,C71
`Chr4:31404557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C71
`Chr4:31404558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A7,B106,B124,B132,B21,B54,B57,B62,B65,B83,C14,C15,C29,C30,C45,C53,C9
`Chr4:31404568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B134,B21,C56
`Chr4:31404588`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B29,B56,B70,C48,C55
`Chr4:31404588`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B29,B56,B70,C48,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808815.1

886 aa

443

886

Helitron_like_N

PIF1

PF14214 Helitron_like_N 115-297 aa PF05970 PIF1 733-886 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808815.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	115	297	1.3e-62	212.2	Helitron helicase-like domain at N-terminus
`XP_057808815.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	733	886	1.3e-67	228.3	PIF1-like helicase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952832.1
ATGGCAAAAGAGAAGATTATTGATCAAAGTCAATCTGATGTCAAGATAAAGCTTATTGGTAGACGACATGGTGATGCTCGAACATATAATCTACCAACCGTATCTGAAGTGGCTGCTTTAGTAGTTGGTGATTTTGATGAATCGATGGGGGATAGAGATTTAATTGTTGAAACGCAAACCGGAGAACTCAAGCGCATTAATGAATTACATGCAACGTATCTTGGTTTGCAGTATCCATTGTTATTCCCATATGGTGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023286
ATGGCAAAAGAGAAGATTATTGATCAAAGTCAATCTGATGTCAAGATAAAGCTTATTGGTAGACGACATGGTGATGCTCGAACATATAATCTACCAACCGTATCTGAAGTGGCTGCTTTAGTAGTTGGTGATTTTGATGAATCGATGGGGGATAGAGATTTAATTGTTGAAACGCAAACCGGAGAACTCAAGCGCATTAATGAATTACATGCAACGTATCTTGGTTTGCAGTATCCATTGTTATTCCCATATGGTGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808815.1
MAKEKIIDQSQSDVKIKLIGRRHGDARTYNLPTVSEVAALVVGDFDESMGDRDLIVETQTGELKRINELHATYLGLQYPLLFPYGEDGFREDIPLNVPGSSSGNNARSNVTMKDYFAFRLHERESDVTTILTSKRLFQQFVVDAYTMIESSRLMYIRMNQKKMRADLYKGLTDALIRGETNPATRGKRVILPSSFVGGARYMVQNYQDAMAICKWARYPNLFITFTCNPKWPEIVRYVEKRGLKPEDRPDIVCRVFKMKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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